Il cilio primario è di fondamentale importanza per la proliferazione delle cellule staminali/progenitrici neurali e per la differenziazione neuronale durante la vita embrionale, postnatale e adulta. Inoltre, la maggior parte dei neuroni differenziati possiede ciglia primarie che ospitano recettori di segnalazione, come i recettori accoppiati a proteine G, e molecole di segnalazione, come le adenilil ciclasi. Il cilio primario determina l'attività di molteplici vie di sviluppo, tra cui la via del riccio sonico durante lo sviluppo neuronale embrionale, e funziona anche nel promuovere la segnalazione subcellulare compartimentalizzata durante la funzione neuronale adulta. Non sorprende che i difetti nella biogenesi e nella funzione del cilio primario siano stati collegati ad anomalie dello sviluppo del cervello, obesità centrale e deficit di apprendimento e memoria. Pertanto, è imperativo studiare la biogenesi del cilio primario e il traffico ciliare nel contesto delle cellule staminali/progenitrici neurali e dei neuroni differenziati. Tuttavia, i metodi di coltura per i neuroni primari richiedono una notevole esperienza e non sono suscettibili di cicli di congelamento-scongelamento. In questo protocollo, discutiamo i metodi di coltura per popolazioni miste di cellule staminali/progenitrici neurali utilizzando neurosfere primarie. I metodi di coltura basati sulla neurosfera offrono i vantaggi combinati dello studio delle cellule staminali/progenitrici neurali primarie: adattabilità a passaggi multipli e cicli di congelamento-scongelamento, potenziale di differenziazione in neuroni/glia e trasfettibilità. È importante sottolineare che abbiamo determinato che le cellule staminali/progenitrici neurali derivate dalla neurosfera e i neuroni differenziati sono ciliati in coltura e localizzano molecole di segnalazione rilevanti per la funzione ciliare in questi compartimenti. Utilizzando queste colture, descriviamo ulteriormente i metodi per studiare la ciliogenesi e il traffico ciliare nelle cellule staminali/progenitrici neurali e nei neuroni differenziati. Questi metodi basati sulla neurosfera ci consentono di studiare i percorsi cellulari regolati dalle ciglia, tra cui il recettore accoppiato a proteine G e la segnalazione del riccio sonico, nel contesto delle cellule staminali/progenitrici neurali e dei neuroni differenziati.