Questo protocollo descrive un metodo per misurare sensibilmente il tasso di trasporto nucleocitoplasmatico nelle cellule NSC-34 come motori neuronali quantificando il cambiamento in tempo reale nell'importazione nucleare di una proteina NLS-NES-GFP.
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Articolo metodologico
Questo protocollo descrive un metodo per misurare sensibilmente il tasso di trasporto nucleocitoplasmatico nelle cellule NSC-34 come motori neuronali quantificando il cambiamento in tempo reale nell'importazione nucleare di una proteina NLS-NES-GFP.
Il trasporto nucleocitoplasmatico si riferisce all'importazione e all'esportazione di grandi molecole dal nucleo cellulare. Recentemente, un certo numero di studi hanno mostrato una connessione tra la sclerosi laterale amyotrofica (ALS) e le alterazioni del percorso nucleocitoplasmatico. L'ALS è una malattia neurodegenerativa che colpisce i neuroni motori e che porta alla paralisi e, infine, alla morte, in media di 2-5 anni. La maggior parte dei casi di ALS sono sporadici, privi di qualsiasi legame genetico apparente, ma il 10% viene ereditato in maniera dominante. Recentemente, le espansioni di ripetizione di esanucleotidi (HRE) nel cromosoma 9 aperto frame di lettura 72 (C9orf72) sono stati identificati come una causa genetica di ALS e demenza frontotemporale (FTD). Importante, diversi gruppi hanno recentemente proposto che queste mutanti influenzino il trasporto nucleocitoplasmatico. Questi studi hanno mostrato in gran parte l'esito finale e le manifestazioni causate dagli HRE sul trasporto nucleocitoplasmatico, ma non dimostrano disfunzioni del trasporto nucleare intempo reale. Di conseguenza, solo la carenza nucleocitoplasmatica di trasporto può essere determinata, soprattutto a causa di un'elevata espressione o di inserimento proteico esogeno.
Questo protocollo descrive un nuovo e molto sensibile dosaggio per valutare e quantificare la disfunzione del trasporto nucleocitoplasmatico in tempo reale. Il tasso di importazione di una proteina NLS-NES-GFP (shuttle-GFP) può essere quantificato in tempo reale utilizzando microscopia fluorescente. Questo viene eseguito usando un inibitore dell'esportin, consentendo così alla navetta GFP di entrare solo nel nucleo. Per convalidare il dosaggio, sono state utilizzate le ripetizioni dei dipeptidi tradotte da C9orf72 HRE, poli (GR) e poli (PR), che sono state precedentemente mostrate per interrompere il trasporto nucleocitoplasmico. Utilizzando il saggio descritto, è stata osservata una diminuzione del 50% del tasso di importazione nucleare rispetto al controllo. Utilizzando questo sistema, possono essere esaminati piccoli cambiamenti nel trasporto nucleocitoplasmatico e la capacità di diversi fattori di salvarlo (anche parzialmente) di un nucleo nucleotiplasmaticoPuò essere determinato il difetto di risposta.
Il complesso dei pori nucleari (NPC) controlla l'importazione e l'esportazione di grandi molecole in e fuori dal nucleo delle cellule. Contrariamente alle piccole molecole, che possono entrare nel nucleo senza regola 1 , il trasporto di molecole più grandi è fortemente controllato dal NPC. Queste grandi molecole, come le proteine e l'RNA, associano fattori di trasporto, comprese le importazioni e le esportazioni, da importare ed esportare dal nucleo 2 . Per essere importato, le proteine devono contenere un piccolo motivo peptidico, generalmente chiamato un segnale di loc....
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1. Preparazione della linea cellulare
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Utilizzando la procedura qui presentata, le cellule NSC-34, come motorie neuroniche, sono state trasfettate con una proteina NLS-NES-GFP (shuttle-GFP). Questa proteina, dotata di sequenze di segnali NLS e NES ( Figura 1 ), può spostarsi tra il nucleo e il citoplasma. Generico GFP può entrare o uscire dal nucleo in assenza di un solo segnale di localizzazione solo per diffusione e viene quindi distribuito uniformemente tra il nucleo e il citoplasma ( Figura 2A
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Questo protocollo dimostra un nuovo test molto sensibile e quantitativo per valutare i minimi cambiamenti nel trasporto nucleocitoplasmatico. Utilizzando questo sistema, è possibile osservare e misurare il trasporto nucleocitoplasmatico e la sua disfunzione in tempo reale, non solo i grandi difetti che comportano cambiamenti drammatici nella distribuzione delle proteine. Questo test non solo ha un vantaggio di sensibilità, ma richiede anche una piccola preparazione, è poco costoso ed è un saggio molto facile e poco affi.......
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Gli autori non hanno niente da divulgare.
Ringraziamo tutti i membri del laboratorio AI per i loro utili commenti e suggerimenti. Vorremmo ringraziare il Prof. Mark Hipp (Istituto Max Planck per la Biochimica) per fornirci il vettore shuttle-GFP. Questo lavoro è stato sostenuto da sovvenzioni della Fondazione israeliana di scienza (ISF # 124/14), della Fondazione Binational Science (BSF # 2013325), della FP7 Marie Curie Career Integration Grant (CIG # 333794) e dell'Istituto Nazionale di Psicobiologia in Israele NIPI # b133-14 / 15).
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| Nome | Azienda | Numero di catalogo | Commenti |
|---|---|---|---|
| Linea cellulare ibrida di tipo neurone motore di topo (NSC-34) | tebu-bio | CLU140-A | |
| DMEM 4,5 g/L L-glucosio | Biological Industries | 01-055-1A | |
| FBS European Grade | Biological Industries | 04-007-1A | |
| SL 16R Centrifuga | Thermo Scientific | 75004030 | |
| Thermo Forma Series ii Water Jacketed CO2 Incubatore | Thermo Scientific | 3111 | |
| Vetro di copertura Ø 12 mm, spessore 0,13-0,17 mm | Bar Naor LTD | ||
| Reagente di trasfezione TurboFect | Thermo Scientific | R0531 | |
| Axiovert 100 microscopio invertito | Zeiss | ||
| Imaging Workbench 2 | Axon Instruments | ||
| Leptomycin B | Sigma | L2913 | |
| PBS | Biological Industries | 02-023-1A | |
| Omogeneizzatore motore/controllo/mandrino/morsetto a 90 gradi | Glas-Col | 099C K5424CE | |
| Centrifuga MicroCL 17R, refrigerata | Thermo Scientific | 75002455 |
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