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Articolo metodologico

Analisi per misurare il trasporto nucleocitoplasmatico in tempo reale all'interno di motori neuronici come le cellule NSC-34

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DOI:

10.3791/55676

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16 maggio 2017

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In questo articolo

Sommario

Questo protocollo descrive un metodo per misurare sensibilmente il tasso di trasporto nucleocitoplasmatico nelle cellule NSC-34 come motori neuronali quantificando il cambiamento in tempo reale nell'importazione nucleare di una proteina NLS-NES-GFP.

Abstract

Il trasporto nucleocitoplasmatico si riferisce all'importazione e all'esportazione di grandi molecole dal nucleo cellulare. Recentemente, un certo numero di studi hanno mostrato una connessione tra la sclerosi laterale amyotrofica (ALS) e le alterazioni del percorso nucleocitoplasmatico. L'ALS è una malattia neurodegenerativa che colpisce i neuroni motori e che porta alla paralisi e, infine, alla morte, in media di 2-5 anni. La maggior parte dei casi di ALS sono sporadici, privi di qualsiasi legame genetico apparente, ma il 10% viene ereditato in maniera dominante. Recentemente, le espansioni di ripetizione di esanucleotidi (HRE) nel cromosoma 9 aperto frame di lettura 72 (C9orf72) sono stati identificati come una causa genetica di ALS e demenza frontotemporale (FTD). Importante, diversi gruppi hanno recentemente proposto che queste mutanti influenzino il trasporto nucleocitoplasmatico. Questi studi hanno mostrato in gran parte l'esito finale e le manifestazioni causate dagli HRE sul trasporto nucleocitoplasmatico, ma non dimostrano disfunzioni del trasporto nucleare intempo reale. Di conseguenza, solo la carenza nucleocitoplasmatica di trasporto può essere determinata, soprattutto a causa di un'elevata espressione o di inserimento proteico esogeno.

Questo protocollo descrive un nuovo e molto sensibile dosaggio per valutare e quantificare la disfunzione del trasporto nucleocitoplasmatico in tempo reale. Il tasso di importazione di una proteina NLS-NES-GFP (shuttle-GFP) può essere quantificato in tempo reale utilizzando microscopia fluorescente. Questo viene eseguito usando un inibitore dell'esportin, consentendo così alla navetta GFP di entrare solo nel nucleo. Per convalidare il dosaggio, sono state utilizzate le ripetizioni dei dipeptidi tradotte da C9orf72 HRE, poli (GR) e poli (PR), che sono state precedentemente mostrate per interrompere il trasporto nucleocitoplasmico. Utilizzando il saggio descritto, è stata osservata una diminuzione del 50% del tasso di importazione nucleare rispetto al controllo. Utilizzando questo sistema, possono essere esaminati piccoli cambiamenti nel trasporto nucleocitoplasmatico e la capacità di diversi fattori di salvarlo (anche parzialmente) di un nucleo nucleotiplasmaticoPuò essere determinato il difetto di risposta.

Introduzione

Il complesso dei pori nucleari (NPC) controlla l'importazione e l'esportazione di grandi molecole in e fuori dal nucleo delle cellule. Contrariamente alle piccole molecole, che possono entrare nel nucleo senza regola 1 , il trasporto di molecole più grandi è fortemente controllato dal NPC. Queste grandi molecole, come le proteine ​​e l'RNA, associano fattori di trasporto, comprese le importazioni e le esportazioni, da importare ed esportare dal nucleo 2 . Per essere importato, le proteine ​​devono contenere un piccolo motivo peptidico, generalmente chiamato un segnale di loc....

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Protocollo

1. Preparazione della linea cellulare

  1. Scavare circa 1.000.000 cellule del midollo spinale del neuroblastoma del mouse (cellule NSC-34) che sono state immagazzinate in un contenitore di azoto liquido. Usare un incubatore ad acqua di 37 ° C fino a quando le cellule sono completamente scongelate.
  2. Aggiungere il terreno fresco e caldo (mezzo DMEM contenente 10% di siero fetale fetale (FBS), 1% di L-glutammina e 1% di antibiotici pen-strep).
  3. Centrifugare le cellule scongelate (SL16R) a 500 xg per 5 minuti, formando un pellet di cellule. Scartare il mezzo e aggiungere 1 ml di nuovo mezzo per la risospensione cellulare.
  4. Posizionare le....

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Risultati

Utilizzando la procedura qui presentata, le cellule NSC-34, come motorie neuroniche, sono state trasfettate con una proteina NLS-NES-GFP (shuttle-GFP). Questa proteina, dotata di sequenze di segnali NLS e NES ( Figura 1 ), può spostarsi tra il nucleo e il citoplasma. Generico GFP può entrare o uscire dal nucleo in assenza di un solo segnale di localizzazione solo per diffusione e viene quindi distribuito uniformemente tra il nucleo e il citoplasma ( Figura 2A

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Discussione

Questo protocollo dimostra un nuovo test molto sensibile e quantitativo per valutare i minimi cambiamenti nel trasporto nucleocitoplasmatico. Utilizzando questo sistema, è possibile osservare e misurare il trasporto nucleocitoplasmatico e la sua disfunzione in tempo reale, non solo i grandi difetti che comportano cambiamenti drammatici nella distribuzione delle proteine. Questo test non solo ha un vantaggio di sensibilità, ma richiede anche una piccola preparazione, è poco costoso ed è un saggio molto facile e poco affi.......

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Dichiarazioni

Gli autori non hanno niente da divulgare.

Ringraziamenti

Ringraziamo tutti i membri del laboratorio AI per i loro utili commenti e suggerimenti. Vorremmo ringraziare il Prof. Mark Hipp (Istituto Max Planck per la Biochimica) per fornirci il vettore shuttle-GFP. Questo lavoro è stato sostenuto da sovvenzioni della Fondazione israeliana di scienza (ISF # 124/14), della Fondazione Binational Science (BSF # 2013325), della FP7 Marie Curie Career Integration Grant (CIG # 333794) e dell'Istituto Nazionale di Psicobiologia in Israele NIPI # b133-14 / 15).

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Materiali

Elenco dei materiali utilizzati in questo articolo
NomeAziendaNumero di catalogoCommenti
Linea cellulare ibrida di tipo neurone motore di topo (NSC-34)tebu-bioCLU140-A
DMEM 4,5 g/L L-glucosioBiological Industries01-055-1A
FBS European GradeBiological Industries04-007-1A
SL 16R CentrifugaThermo Scientific75004030
Thermo Forma Series ii Water Jacketed CO2 IncubatoreThermo Scientific3111
Vetro di copertura Ø 12 mm, spessore 0,13-0,17 mmBar Naor LTD
Reagente di trasfezione TurboFectThermo ScientificR0531
Axiovert 100 microscopio invertitoZeiss
Imaging Workbench 2Axon Instruments
Leptomycin BSigmaL2913
PBSBiological Industries02-023-1A
Omogeneizzatore motore/controllo/mandrino/morsetto a 90 gradiGlas-Col099C K5424CE
Centrifuga MicroCL 17R, refrigerataThermo Scientific75002455

Riferimenti

  1. Alberts, B. Molecular biology of the cell. , 4th edn, Garland Science. (2002).
  2. Freitas, N., Cunha, C. Mechanisms and signals for the nuclear import of proteins. Curr Genomics. 10, 550-557 (2009).
  3. Kalderon, D., Roberts, B. L., Richardson, W. D., Smith, A. E.

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Ristampe e permessi

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