Summary

해로운 효과의 낮은 압력 플라즈마 살 균 새 균의 subtilis 포자를 사용 하 여 라이브 셀 현미경의 생존에 조사

Published: November 30, 2017
doi:

Summary

이 프로토콜 추적에 의해 모니터링 활력 매개 변수 및 저압 플라즈마 처리 후 새 균의 subtilis 포자를 되살리는에서 DNA 복구 프로세스의 관련성을 평가 하는 데 필요한 중요 한 연속 단계를 보여 줍니다. 형광 표시 DNA 복구 시간 해결 confocal 현미경 검사 법 및 전자 현미경 검사를 통해 단백질.

Abstract

플라즈마 살 균 산업, 임상, 및 spaceflight 목적으로 기존의 살 균 방법에 유망한 대안 이다. 저압 플라즈마 (LPP) 방전 급속 한 미생물 비활성화 이어질 활성 종의 광범위 한 스펙트럼을 포함. 효율성과 LPP에 의해 살 균의 메커니즘 연구, 우리는 기존의 살 균 절차에 대 한 그들의 특별 한 저항 때문에 새 균의 subtilis 테스트 기체의 포자를 사용 합니다. 우리는 B. subtilis 포자 monolayers, 이중 유도 결합된 플라즈마 반응 기, 스캐닝 전자 현미경 (SEM)을 사용 하 여 포자 형태학의 특성에서에서 저압 플라즈마에 의해 살 균 과정의 생산을 설명 하 고는 발 아 및 라이브 셀 현미경으로 포자의 파생물의 분석. 플라즈마의 주요 대상 게놈 소재 (DNA) 이며 포자 부흥 시 플라즈마 유도 DNA 장애의 복구는 생물의 생존을 위해 중요 한. 여기, 우리는 포자의 발 아 능력을 연구 하 고 DNA의 역할 붙일 이라는 DNA 복구 단백질 (RecA) 시간 해결 공초점 형광 현미경 검사 법으로 추적 하 여 LPP와 치료 후 포자 발 아 및 파생물 복구 합니다. 치료 및 치료 포자 monolayers는 발 아에 대 한 활성화 개별 포자의 반응에 따라 시간이 지남에 거꾸로 confocal 라이브 셀 현미경으로 시각. 우리의 관측 공개 출 아 포자를 빨리 성장 하 고 일부 LPP 트리트먼트 120 s. RecA YFP (노란색 형광 단백질) 형광 몇 포자에만 감지 되 고 모두에 개발 되었다 후 최소에 도달의 기간에 따라 달라 집니다. LPP 취급 포자에 약간의 상승으로 빨리 성장 세포. 또한, 일부 식물 박테리아의 세포질에 있는 증가 보여주었다 LPP 취급 포자에서 파생 된 그리고 lyse 경향이. 개별 포자의 분석에 대 한 설명된 방법 포자 발 아 및 파생물의 다른 측면의 연구에 대 한 훌륭한 될 수 있습니다.

Introduction

우주 탐사의 주요 목표는 생명체와 다른 행성 몸과 우리의 태양계에 있는 달에 생체의 서명에 대 한 검색입니다. 미생물의 전송 또는 탐험의 중요 한 영역을 지구 근원의 생체 개발 및 생활 탐지 임무 화성과 유로 파1등 행성의 시체의 무결성을 영향을 미칠 특정 위험입니다. 여는 위원회의 공간 연구 (COSPAR) 1967 년에에서 설립, 행성 보호의 국제 지침 다른 행성, 그들의 위성, 소행성, 및 다른 천체를 유인 하 고 로봇 임무에 대 한 엄격한 규제를 부과 하 고 규제는 청소 및 살 균 지상파 미생물 오염 제거 하 고 천체2의 교차 오염을 방지 하기 위하여 발사 하는 우주선과 이전 중요 한 하드웨어 구성 요소. 지난 10 년간 비 열 플라즈마의 응용 spaceflight 응용 프로그램3,,45뿐만 아니라 생물 의학 및 영양 연구에 광범위 한 관심을 얻고 있다. 신속 하 고 효율적인 미생물 비활성화6을 민감한 부드러운 고 열 불안정 물질 동안 제공 플라즈마 살 균은 기존의 살 균 방법에 유망한 대안 이다. 플라즈마 방전 자유 래 디 칼, 입자, 중립/흥분 원자, 광자 자외선 (UV), 진공 자외선 (VUV) 스펙트럼에 있는 급속 한 미생물 비활성화3반응 요원의 혼합물을 포함 합니다. 이 연구에서 우리는 새 균의 subtilis endospores 유리 테스트 표면에 배포를 비활성화 하 이중 저압 유도 결합된 플라즈마 (DICP) 소스7,8 에 의해 생성 된 저압 플라즈마를 사용 합니다.

가족 Bacillaceae 의 그람 양성 박테리아는 토양, 퇴적 물, 및 클린 룸 시설 등 국제 우주 정거장9,10 비정상적인 환경에서 뿐만 아니라 공기의 자연 서식 지에 널리 배포 ,11. 속 의 가장 뚜렷한 특징은 영양소 고갈12등 불리 한 조건, 살아남기 위해 저항력 휴면 endospores (포자 라 함)을 형성 하는 기능 이다. 포자는 일반적으로 훨씬 더 다양 한 트리 트 먼 트 및 환경 스트레스, 열, 자외선, 감마 방사선, 건조, 기계적 장애, 및 강한 산화 제와 같은 독성 화학 물질을 포함 하 여 식물 세포 들 보다 저항 또는 pH 변화 에이전트 (참조13,14에서 검토) 되며 따라서 미생물 비활성화 방법의 효율성을 테스트 하기 위한 이상적인 개체. 때문에 genomic DNA는 박테리아15,16, 병 변의 플라즈마 유도 DNA 수리의 플라즈마 처리의 주요 목표 (예: DNA 이중 가닥 나누기) 포자에 부흥은 박테리아13의 생존을 위해 중요 한 17.

따라서, 우리 연구 포자의 발 아 용량 및 DNA 복구의 역할 포자 발 아 및 파생물 다음 개별 포자에 의해 낮은 압력 아르곤 플라즈마와 포자를 치료 후 하 고 형광 표시 DNA의 그들의 표현을 수리합니다 시간이 해결 공초점 형광 현미경 검사 법으로 단백질 RecA. 우리는 재현할 수 있는 테스트 결과, 저압 플라즈마 살 균에 대 한 포자 monolayers의 처리, 플라즈마 처리 포자에 대 한 준비를 달성 하기 위한 monolayers에 B. subtilis 포자의 준비의 단계 지시를 주고 ultrastructural 평가 모니터링 활성 DNA와 함께에서 개별 포자의 수준에서 스캐닝 전자 현미경 (SEM), 그리고 라이브 셀 현미경 분석을 사용 하 여 셀 내에 플라즈마 처리에 발생 하는 프로세스를 복구 합니다.

Protocol

1. 새 균의 subtilis 포자 생산 및 정화 포자 생산에 대 한 각각의 5 mL 하룻밤 문화 전송 B. subtilis 스트레인, 적절 한 항생제, 200 mL (당 리터 16 g 영양 국물, KCl 2 g, 0.5 g MgSO 더블 강도 액체 쉐 퍼 포자 형성 매체를 보충 4* 7 H2O 2 mL 1 M Ca (3)2, 2 mL의 0.1 m M MnCl2 * • 4 H2O 2 mL 1 m m FeSO4, 2 mL 50% (w/v) 포도 당18) 72 h 또?…

Representative Results

플라즈마 처리 B. subtilis 의 생존 포자 B. subtilis 포자의 플라즈마 처리 사용이 연구 보기 생존 감소 (그림 2) 플라즈마 처리의 내구 증가 함께. RecA표현 스트레인의 포자-YFP 융합 유전자 유전 수정 세균 활력에 더 큰 영향을에 나타내는 야생 유형 긴장의 포자와 비슷한 생존 곡선을 보여주?…

Discussion

낮은 온도 사용 하 여 표면 살 균, 저압 플라즈마는 이온화 방사선, 화학 치료 등 오히려 기존의 살 균 절차를 유망한 대안 (예: 가스 H2O2 와 같은 또는 에틸렌 산화물) 또는 건조 하 고 습 한 열23. 일반 살 균 방법을 주로 효과적인 살 균을 제공 하지만 그들은 치료 재료 영향 및 연산자에 대 한 잠재적인 위험을 나타내는 알려져 있습니다. 저압 플라즈마는 자…

Divulgazioni

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

저자는 그녀의 도움을 비디오 촬영 하는 동안이 작업 및 Nikea J. 울 리 히의 부분 그녀의 우수한 기술 지원에 대 한 안드레아 슈뢰더를 감사합니다. 우리는 또한 새 균의 subtilis 긴장의 그의 관대 한 기부에 대 한 일 A. 시 몬스를 감사 하 고 싶습니다: LAS72 및 LAS24. 이 작품은 부분에서 교부 금에 의해에서 지원 독일 연구 재단 (DFG) Paketantrag (PlasmaDecon 박 728) PA (AW 7/3-1) 고 RM (모 2023/2-1)와 DLR DLR-FuW-프로젝트 ISS 생활, 프로그램 RF-FuW, Teilprogramm 475 (F.M.F, M.R. R.M.)를 부여 합니다. F.M.F. (6 년의 기간 동안 헬름홀츠 협회 (헬름홀츠 Gemeinschaft)에 의해 투자 되었다 쾰른, 독일, 독일 항공 우주 센터 (DLR)를에서 헬름홀츠 공간 생명 과학 연구 학교 (SpaceLife)의 박사 학위 장학금에 의해 지원 되었다 부여 번호 VH-KO-300) 항공 집행 위원회와 항공 우주 의학 연구소를 포함 하 여 DLR에서 추가 자금을 받았다. 이 연구의 결과 펠릭스 M. Fuchs의 박사 논문에 포함 될 것입니다.

Materials

Two substance nozzle (model 970-8) Schlick 14,404 230 V, 50 Hz, D 4.484/8, 0.8 mm bore diameter
Luria Bertani Medium Sigma Aldrich 70122-100G
Tube connectors Festo n/a G 1/8
Magnetvalve DO35-3/2NC-G018-230AC Bosch Rexroth 820005100
PLN Polyamid tube Festo 558206 d = 6 mm
Glass slides VWR 48300-026
Electric Timer 550-2-C Gefran F000074 220 V
attofluor cell chamber Menzel, Fisher Ref. 3406816 d=25 mm, round
MgSO4*7 H2O Sigma Aldrich 13152
Ca(NO3)2 Sigma Aldrich 202967
MnCl2 * 4 H2O Sigma Aldrich 244589
FeSO4 * 7H2O AppliChem 13446-34-9
Glucose Merck 215422
KCl Sigma Aldrich P9541-500G
Nutrient Broth (NB) Merck 105443
Luria-Bertani (LB) Merck 110283
96-wellplate ThermoFisher 243656
Zeiss LSM 780, Axio Observer Z1 Carl Zeiss Microscopy GmbH n/a
Leo 1530 Gemini Carl Zeiss Microscopy GmbH n/a
ZEN 2 and ZEN lite 2012 (Software) Carl Zeiss Microscopy GmbH n/a
SigmaPlot, version 13.0 (Statistic software) Systat GmbH, Erkrath, Germany n/a
Attofluor cell chamber Invitrogen A7816
µ-Dish 35 mm, high Grid-500 Glass Bottom ibidi 81168

Riferimenti

  1. Nicholson, W. L., Schuerger, A. C., Race, M. S. Migrating microbes and planetary protection. Trends Microbiol. 17, 389-392 (2009).
  2. COSPAR. COSPAR Planetery Protection Policy. Space Research Today, COSPAR’s Information Bulletin. 193, 1-14 (2015).
  3. De Geyter, N., Morent, R. Nonthermal plasma sterilization of living and nonliving surfaces. Annu Rev Biomed Eng. 14, 255-274 (2012).
  4. Shimizu, S., et al. Cold atmospheric plasma – A new technology for spacecraft component decontamination. Planet. Space Sci. 90, 60-71 (2014).
  5. Lerouge, S., Fozza, A. C., Wertheimer, M. R., Marchand, R., Yahia, L. H. Sterilization by Low-Pressure Plasma: The Role of Vacuum-Ultraviolet Radiation. Plasma Polym. 5, 31-46 (2000).
  6. Rossi, F., Kylián, O., Rauscher, H., Gilliland, D., Sirghi, L. Use of a low-pressure plasma discharge for the decontamination and sterilization of medical devices. Pure Appl. Chem. 80, 1939-1951 (2008).
  7. Halfmann, H., Hauser, J., Awakowicz, P., Koller, M., Esenwein, S. A. A double inductively coupled low-pressure plasma for sterilization of medical implant materials. Biomed Tech (Berl). 53, 199-203 (2008).
  8. Halfmann, H., Denis, B., Bibinov, N., Wunderlich, J., Awakowicz, P. Identification of the most efficient VUV/UV radiation for plasma based inactivation of Bacillus atrophaeus spores. J. Phys. D: Appl. Phys. 40, 5907 (2007).
  9. Vaishampayan, P., et al. Bacillus horneckiae sp. nov., isolated from a spacecraft-assembly clean room. Int J Syst Evol Microbiol. 60, 1031-1037 (2010).
  10. Mandic-Mulec, I., Stefanic, P., van Elsas, J. D. Ecology of Bacillaceae. Microbiol Spectr. 3, (2015).
  11. Alekhova, T. A., et al. Diversity of bacteria of the genus Bacillus on board of international space station. Dokl Biochem Biophys. 465, 347-350 (2015).
  12. Claus, D., Bekerley, R. C. W., Sneath, P. A. Genus Bacillus Cohn 1872. Bergey’s manual of systematic bacteriology. 2, 1105-1141 (1986).
  13. Setlow, P. Spore Resistance Properties. Microbiol Spectr. 2, (2014).
  14. Setlow, P. Spores of Bacillus subtilis: their resistance to and killing by radiation, heat and chemicals. J Appl Microbiol. 101, 514-525 (2006).
  15. Roth, S., Feichtinger, J., Hertel, C. Characterization of Bacillus subtilis spore inactivation in low-pressure, low-temperature gas plasma sterilization processes. J Appl Microbiol. 108, 521-531 (2010).
  16. Roth, S., Feichtinger, J., Hertel, C. Response of Deinococcus radiodurans to low-pressure low-temperature plasma sterilization processes. J Appl Microbiol. 109, 1521-1530 (2010).
  17. Setlow, B., Setlow, P. Role of DNA repair in Bacillus subtilis spore resistance. J Bacteriol. 178, 3486-3495 (1996).
  18. Schaeffer, P., Millet, J., Aubert, J. P. Catabolic repression of bacterial sporulation. Proc. Natl. Acad. Sci. 54, 704-711 (1965).
  19. Simmons, L. A., et al. Comparison of responses to double-strand breaks between Escherichia coli and Bacillus subtilis reveals different requirements for SOS induction. J Bacteriol. 191, 1152-1161 (2009).
  20. Raguse, M., et al. Improvement of Biological Indicators by Uniformly Distributing Bacillus subtilis Spores in Monolayers To Evaluate Enhanced Spore Decontamination Technologies. Appl Environ Microbiol. 82, 2031-2038 (2016).
  21. Horneck, G., et al. Protection of bacterial spores in space, a contribution to the discussion on Panspermia. Orig Life Evol Biosph. 31, 527-547 (2001).
  22. Opretzka, J., Benedikt, J., Awakowicz, P., Wunderlich, J., Keudell, A. v. The role of chemical sputtering during plasma sterilization of Bacillus atrophaeus. J. Phys. D: Appl. Phys. 40, 2826 (2007).
  23. Stapelmann, K., et al. Utilization of low-pressure plasma to inactivate bacterial spores on stainless steel screws. Int. J. Astrobiol. 13, 597-606 (2013).
  24. Raguse, M., et al. Understanding of the importance of the spore coat structure and pigmentation in the Bacillus subtilis spore resistance to low-pressure plasma sterilization. J. Phys. D: Appl. Phys. 49, 285401 (2016).
  25. Pandey, R., et al. Live cell imaging of germination and outgrowth of individual Bacillus subtilis spores; the effect of heat stress quantitatively analyzed with SporeTracker. PloS one. 8, e58972 (2013).
check_url/it/56666?article_type=t

Play Video

Citazione di questo articolo
Fuchs, F. M., Raguse, M., Fiebrandt, M., Madela, K., Awakowicz, P., Laue, M., Stapelmann, K., Moeller, R. Investigating the Detrimental Effects of Low Pressure Plasma Sterilization on the Survival of Bacillus subtilis Spores Using Live Cell Microscopy. J. Vis. Exp. (129), e56666, doi:10.3791/56666 (2017).

View Video