Transtorasik (TTE) ve transözofageal (TEE) ekokardiyografi interatriyal septum muayenesi için temel görüntüleme araçlarını temsil eder. Üç boyutlu (3D) TEE, interatrial septumun değerlendirilmesinde artımlı bilgi sağlar. Kalp odalarının hassas hacimsel ve fonksiyonel değerlendirmesi için benek izleme ekokardiyografisi kullanılarak ileri ekokardiyografi teknikleri uygulanır.