सूक्ष्म प्रणालियों की भौतिक मॉडलिंग अंतर्दृष्टि प्राप्त करने में मदद करती है जो अन्य साधनों से हासिल करना मुश्किल है। शारीरिक आणविक मॉडल के निर्माण को सुविधाजनक बनाने के लिए, हम प्रदर्शित करते हैं कि कैसे 3 डी प्रिंटिंग का उपयोग कार्यात्मक स्थूल मॉडलों को इकट्ठा करने के लिए किया जा सकता है जो आणविक प्रणालियों के गुणों को स्पर्श तरीके से कैप्चर करते हैं।
3 डी प्रिंटिंग की पहुंच में वृद्धि के साथ, रासायनिक प्रयोगशालाओं और रासायनिक शिक्षा में योजक विनिर्माण प्रक्रियाओं में वृद्धि और रुचि रही है। आणविक प्रणालियों के भौतिक मॉडलिंग के लंबे और सफल इतिहास पर निर्माण, हम आणविक संरचनाओं के 3डी प्रिंटिंग की सुविधा के लिए एक प्रोटोकॉल के साथ चुनिंदा मॉडल पेश करते हैं जो आकार और कनेक्टिविटी का प्रतिनिधित्व करने से अधिक करने में सक्षम हैं। वर्णित मॉडलों में संतृप्त हाइड्रोकार्बन संरचनाओं में गतिशील पहलुओं और स्वतंत्रता की डिग्री को शामिल किया गया है। एक प्रतिनिधि उदाहरण के रूप में, साइक्लोहेक्सेन को मुद्रित भागों से इकट्ठा किया गया था और विभिन्न थर्मोप्लास्टिक का उपयोग करके समाप्त किया गया था, और परिणामस्वरूप मॉडल विभिन्न पैमानों पर अपनी कार्यक्षमता बनाए रखते हैं। परिणामस्वरूप संरचनाएं गणना और साहित्य के अनुरूप विन्यास अंतरिक्ष पहुंच दिखाती हैं, और इन संरचनाओं के संस्करणों का उपयोग उन अवधारणाओं को चित्रित करने के लिए एड्स के रूप में किया जा सकता है जिन्हें अन्य तरीकों से व्यक्त करना मुश्किल है। यह अभ्यास हमें सफल प्रिंटिंग प्रोटोकॉल का मूल्यांकन करने, असेंबली के लिए व्यावहारिक सिफारिशें करने और आणविक प्रणालियों के भौतिक मॉडलिंग के लिए डिजाइन सिद्धांतों की रूपरेखा तैयार करने में सक्षम बनाता है। प्रदान की गई संरचनाएं, प्रक्रियाएं और परिणाम 3 डी प्रिंटिंग के साथ आणविक संरचना और गतिशीलता के व्यक्तिगत निर्माण और अन्वेषण के लिए एक नींव प्रदान करते हैं।
आणविक संरचना निर्माण लंबे समय से अणुओं के बीच के आकार और बातचीत के बारे में हमारी समझ की खोज और सत्यापन के लिए एक महत्वपूर्ण पहलू रहा है। भौतिक मॉडल निर्माण पॉलिंग एट अल द्वारा प्रोटीन में α-हेलिक्ससंरचना के निर्धारण में एक प्रेरक पहलू था।1,पानी की प्राथमिक क्लैथरेट हाइड्रेटसंरचना 2,,3,और वाटसन और क्रिक4द्वारा डीएनए की डबल-हेलिक्स संरचना। डीएनए संरचना के जेम्स वाटसन के प्रकाशित खाते में, वह इस तरह के मॉडल निर्माण में सामना करना पड़ा संघर्ष के कई विवरण, जैसे मॉडल कार्बन परमाणुओं के आसपास एक तांबे के तार लपेटन के लिए फास्फोरस परमाणुओं बनाने के लिए, परमाणुओं के अनिश्चित नाजुक निलंबन, और कुर्सियां के गत्ता कटआउट बनाने जबकि मशीन की दुकान से टिन कटआउट पर इंतज़ार कर5। मॉडल निर्माण में इस तरह के संघर्षों को काफी हद तक कम्प्यूटेशनल मॉडलिंग बढ़ाने या पूरी तरह से भौतिक दृष्टिकोणों को सुलगाने के साथ सुधारा गया है, हालांकि भौतिक मॉडल रासायनिक शिक्षा और,प्रयोग6,7,8,9 में एक अनिवार्य पहलू बनेहुएहैं।,,
लगभग 2010 के बाद से, 3 डी प्रिंटिंग ने रचनात्मक डिजाइन और विनिर्माण के लिए एक उपकरण के रूप में गोद लेने में महत्वपूर्ण वृद्धि देखी है। यह वृद्धि प्रौद्योगिकी के व्यापक व्यावसायीकरण पर केंद्रित नई कंपनियों की एक श्रृंखला से विभिन्न प्रकार के फ्यूज्ड-डिपॉजिटेशन मॉडलिंग (एफडीएम) प्रिंटर की प्रतिस्पर्धा और उपलब्धता से प्रेरित है । बढ़ती पहुंच के साथ, रसायन विज्ञान शिक्षा और प्रायोगिक प्रयोगशाला सेटिंग्स,,,10, 11, 12, 13,,,14, 15,16,,,17,,1718,,19,1320, 21,21में इन प्रौद्योगिकियों19केअनुप्रयोग में समवर्ती वृद्धि हुई है।18 इस समय अवधि के दौरान, एनआईएच 3डी प्रिंट एक्सचेंज22जैसे 3 डी मॉडलों के लिए वाणिज्यिक और खुले सामुदायिक भंडार दोनों ने 3डी प्रिंटिंग के लिए मॉडल सिस्टम बनाए हैं, हालांकि इनमें से कई मॉडल विशिष्ट लक्षित अणुओं पर केंद्रित होते हैं और बांड कनेक्टिविटी और प्रकार पर जोर देने के साथ सरल स्थिर संरचनाएं प्रदान करते हैं। अधिक सामान्य परमाणु और आणविक समूह अधिक रचनात्मक निर्माण12, 23,को सक्षम कर सकते हैं, और ऐसे मॉडलों की आवश्यकता है जो आणविकसंरचनाओंके लिए स्पर्श, गतिशील और संवेदनशील प्रतिक्रिया के साथ सामान्य संरचना निर्माण को सक्षम कर सकें।
यहां, हम आणविक मॉडल संरचना घटकों को पेश करते हैं जिन्हें संतृप्त हाइड्रोकार्बन के गतिशील आणविक मॉडल बनाने के लिए आसानी से मुद्रित और इकट्ठा किया जा सकता है। घटक संरचनाएं एक व्यापक किट का हिस्सा हैं जो हमने अपनी प्रयोगशाला और विश्वविद्यालय के लिए विस्तार और आउटरीच गतिविधियों के लिए विकसित की हैं। प्रदान किए गए भागों को कमोडिटी एफडीएम 3 डी प्रिंटर पर विभिन्न प्रकार के बहुलक फिलामेंट प्रकारों के साथ प्रिंट करने योग्य बनाने के लिए इंजीनियर किया गया है। हम एकल और दोहरे एक्सट्रूडर एफडीएम प्रिंटर दोनों से विभिन्न पॉलीमर और फिनिशिंग तकनीकों का उपयोग करके मॉडल परिणाम पेश करते हैं। ये घटक स्केलेबल हैं, जो बड़े व्याख्यान सेटिंग्स में व्यक्तिगत जांच और प्रदर्शन दोनों के लिए उपयुक्त मॉडल विनिर्माण को सक्षम करते हैं।
इस रिपोर्ट का प्राथमिक उद्देश्य 3 डी प्रिंटिंग के साथ अधिक भौतिक तरीकों से रासायनिक संरचना विवरण और ज्ञान का अनुवाद करने में अन्य शोधकर्ताओं और शिक्षकों की सहायता करना है। इस उद्देश्य के लिए, हम विभिन्न पैमानों पर साइक्लोहेक्सेन को कोडांतरण और हेरफेर करके एक उदाहरण आवेदन को हाइलाइट करते हैं। परिचयात्मक जैविक रसायन विज्ञानपाठ्यक्रमोंमें छह सदस्यीय रिंग सिस्टम संरचनाएं एक मुख्य विषय हैं , और ये अनुरूप अंगूठी और चीनी संरचनाओं की प्रतिक्रियाशीलता में एक कारक हैं25,26,,27. मुद्रित मॉडल लचीले ढंग से कुंजी अंगूठी अनुरूप24को अपनाते हैं, और अंगूठी अंतरवर्तन रास्तों के लिए आवश्यक बल सीधे पता लगाया जा सकता है और गुणात्मक हाथ से मूल्यांकन किया जा सकता है।
इस अध्ययन का प्राथमिक उद्देश्य कमोडिटी 3 डी प्रिंटर के साथ गतिशील आणविक मॉडल की क्राफ्टिंग के लिए एक प्रोटोकॉल की रिपोर्ट करना है। ये प्रिंटर तेजी से सुलभ हैं, अक्सर पुस्तकालयों, स्कूलों और अन्य स्थानों में उपयोग करने के लिए भी स्वतंत्र होते हैं। शुरू हो रही है दोनों मॉडल के बारे में विकल्प बनाने के लिए प्रिंट और सामग्री का उपयोग करें और इन विकल्पों से निर्णय लेने के लिए क्या रचनात्मक योजक विनिर्माण अनुसंधान और अनुदेश के लिए कर सकते है के बारे में कुछ प्रेरणा की आवश्यकता हो सकती है शामिल है । इन मुद्दों के समाधान के लिए, हम कुछ व्यावहारिक सामग्री सिफारिशें प्रदान करते हैं, मॉडल भागों का सुझाव दिया, एक 3 डी प्रिंटिंग प्रोटोकॉल, और एक उदाहरण आवेदन, जिनमें से प्रत्येक आगे चर्चा वारंट ।
3डी प्रिंटिंग में उपयोग के लिए थर्मोप्लास्टिक के कई विकल्प हैं। हम प्रस्तुत प्रोटोकॉल में तीन को हाइलाइट करते हैं क्योंकि ये तीन सामग्रियां वर्तमान में अपने आप में 3 डी प्रिंटिंग के लिए सबसे व्यापक रूप से उपलब्ध हैं। विकल्प इस बात पर निर्भर हो सकता है कि उपलब्ध 3डी प्रिंटर द्वारा किस सामग्री का समर्थन किया जाता है, उदाहरण के लिए कई खुली पहुंच सुविधाएं केवल पर्यावरणीय बाधाओं के कारण पीएलए के साथ प्रिंट होंगी। पीएलए एक बायोडिग्रेडेबल और कंपोजिट मैटेरियल है जिसमें हल्के तापमान सेटिंग्स के साथ प्रिंटिंग प्रोटोकॉल है । एबीएस और पीईटीजी दोनों कम पर्यावरण के अनुकूल हैं और आम तौर पर पुनर्नवीनीकरण योग्य नहीं हैं, हालांकि पीईटीजी अत्यधिक पुनर्नवीनीकरण पॉलीथीन टेरेफ्थेलेट (पीईटी) पर आधारित है और अंततः पीईटी की तरह व्यापक प्रसार पुनर्प्रसंस्करण देख सकता है। टिकाऊ मुद्रण प्रथाओं में प्रिंट गुणवत्ता और प्रिंट सफलता दोनों को सुनिश्चित करने के लिए एक समय में कुछ भागों को मुद्रित करना शामिल होगा, यह संभव के रूप में कम त्याग सामग्री (समर्थन संरचनाओं, राफ्ट, रसना ढाल, आदि) के रूप में उपयोग करते हुए। पीएलए भंगुर हो सकता है, इसलिए यदि उपलब्ध है, तो एबीएस और पीईटीजी थर्मोप्लास्टिक प्रिंट में परिणाम कर सकते हैं जो अधिक यांत्रिक रूप से लचीला हैं और क्रमशः परत आसंजन में सुधार हुआ है। ये गुण एक इंटरैक्टिव आणविक मॉडल के लिए वांछनीय हो सकते हैं जो प्रयोगशाला या कक्षा सेटिंग में नियमित हेरफेर देखेंगे।
यहां प्रस्तुत मॉडल इन विचारों को ध्यान में रखते हैं, हालांकि वे सबसे पहले गतिशील आणविक मॉडल निर्माण को सक्षम करने के लिए एक साथ काम करने के लिए इंजीनियर हैं। डिफ़ॉल्ट पैमाने पर, वे इंटरैक्टिव आणविक संरचनाओं में सफलतापूर्वक इकट्ठा होंगे। वे आसानी से बड़े मॉडलों तक पहुंचा जा सकता है, हालांकि विधानसभा को अधिक बल की आवश्यकता होगी क्योंकि कनेक्शन शूल बड़े आकार में विकृत करने के लिए कम आसान हैं। घटकों को सिकुड़ने में, आकार में 50% की कमी अभी भी मामूली संशोधनों के साथ काम करेगी, जैसे कार्बन परमाणु मॉडल को 48\u201249% तक सिकुड़ना, जबकि बॉन्ड और हाइड्रोजन परमाणु को 50% पर रखते हुए पीएलए प्रिंट में भागों के बीच सख्त कनेक्शन सक्षम करने के लिए। मॉडल इस छोटे से अधिक नाजुक हैं और अक्सर सफलतापूर्वक प्रिंट करने के लिए बेड़ा संरचनाओं की आवश्यकता होती है, लेकिन वे अभी भी गतिशील आणविक मॉडल के रूप में कार्यात्मक हैं।
थर्मोप्लास्टिक सामग्री और प्रिंट करने के लिए चुने गए मॉडल 3 डी प्रिंटिंग प्रोटोकॉल के दो सबसे महत्वपूर्ण पहलू हैं। चुना थर्मोप्लास्टिक तापमान, आसंजन, एनीलिंग, और परिष्करण विचार और विकल्पों को निर्देशित करेगा। यदि उपलब्ध 3 डी प्रिंटर में गर्म बिस्तर नहीं है, तो पीएलए प्रस्तुत थर्मोप्लास्टिक विकल्पों में से केवल एक है जो पुन: पेश किए गए हिस्सों को प्रिंट करेगा। जबकि प्रदान किए गए भागों को विभिन्न थर्मोप्लास्टिक के साथ पुन: मुद्रित करने और गतिशील हेरफेर तक रखने के लिए डिज़ाइन किया गया है, प्रिंट बढ़ते तनाव के तहत रखे जाने पर प्रिंट परतों के बीच अक्सर उपयोग और दरार के साथ नीचा होगा। ऐसी स्थितियों में, प्रतिस्थापन भाग प्रिंट करना आसान और अपेक्षाकृत लागत प्रभावी है।
प्रदान किए गए मॉडलों से मुद्रित आणविक विधानसभाओं की गतिशील कार्यक्षमता इस काम को अन्य उपलब्ध और 3 डी प्रिंट करने योग्य मॉडल से अलग करती है जो मुख्य रूप से कनेक्टिविटी और बॉन्डिंग प्रकारों को उजागर करती हैं। गतिशील पहलुओं को उदाहरण साइक्लोहेक्सेन संरचना के साथ छोटे हिस्से में प्रस्तुत किया जाता है। साइक्लोहेक्सेन का विन्यास परिदृश्य इन मॉडलों का उपयोग करके सीधे रूप से सुलभ है, और इन परिदृश्यों की टोपोलॉजी कम्प्यूटेशनल जांच के साथ सामान्य समझौते में हैं। इस के अधिकांश आणविक ज्यामिति और इन भौतिक मॉडलिंग घटकों में स्वतंत्रता की डिग्री की बारीकियों के लिए एक संमान से आता है । α-हेलिक्स 1की संरचना की खोज में उनकी सफलता1पर लिनस पॉलिंग की टिप्पणी में, उन्होंने दावा किया कि उनके समकालीनों को आदर्शवादी अभिन्न मान्यताओं से आने वाली कठिनाइयों का सामना करना पड़ा और “… सरल पदार्थों की हमारी जांच द्वारा दिए गए अंतरपरमाण्विक दूरी, बांड कोण और संयुग्मित समूह की योजनाकारता के बारे में आवश्यकताओं के लिए केवल एक मोटा सन्निकटन। इन पंक्तियों के साथ अधिक मात्रात्मक अंतर्दृष्टि इन मॉडल भागों के निर्माण में लिए गए विचारों की तुलना में अधिक विशिष्ट विस्तार की आवश्यकता है, लेकिन इन मॉडलों और सिफारिशों आणविक प्रणालियों के सामांय इंटरैक्टिव शारीरिक जांच के लिए एक नींव प्रदान करते हैं । ये मॉडल 3 डी प्रिंट करने योग्य मॉडल किट का विस्तार हैं जो हम इस रिपोर्ट से पहले कई वर्षों से अनुसंधान और आउटरीच गतिविधियों के लिए उत्पादन कर रहे हैं, और अतिरिक्त घटक भाग जो इन दोनों मॉडलों के साथ संगत हैं और वर्णित प्रोटोकॉल लेखकों से अधिक विविध संबंध व्यवस्था और गतिशील कार्रवाई को सक्षम करने के लिए उपलब्ध हैं।
The authors have nothing to disclose.
इस काम को नेशनल साइंस फाउंडेशन (एनएसएफ) ने ग्रांट नंबर एक के तहत सपोर्ट किया था । चे-1847583।
ABS: Black 1.75 mm filament spool, 1 kg | MakerBot | MP01969 | Obtained from reseller (B&H and/or Amazon). |
ABS: Dark Gray 1.75 mm filament spool, 1 kg | Amazon | B07T6W8TRF | Obtained from reseller (B&H and/or Amazon). |
ABS: White 1.75 mm filament spool, 1 kg | Hatchbox | B00J0H6NNM | Obtained from reseller (B&H and/or Amazon). |
Crown Acetone, 1 Gallon | Crown | 206539 | Obtained from a hardwares store (Lowes). |
MakerGear M2 | MakerGear | This printer is more costly than inexpensive FDM printers obtainable on Amazon or other sites, but it is engineered for more consistent performance. | |
MakerGear M2 Dual | MakerGear | This model printer is no longer available for purchase. It has been replaced with a new model that has independent dual extruders. | |
Multi-Surface 1.88-in Painters Tape | 3M | 116480 | Obtained from a hardwares store (Lowes). |
PETG: Pink 1.75 mm filament spool, 1 kg | Amazon | Obtained from reseller (B&H and/or Amazon). No longer available from this company. | |
PETG: White 1.75 mm filament spool, 1 kg | Amazon | Obtained from reseller (B&H and/or Amazon). No longer available from this company. | |
PLA: Black 1.75 mm filament spool, 2 lb | MakerBot | MP05775 | Obtained from reseller (B&H and/or Amazon). |
PLA: Cool Gray 1.75 mm filament spool, 2 lb | MakerBot | MP05784 | Obtained from reseller (B&H and/or Amazon). |
PLA: White 1.75 mm filament spool, 2 lb | MakerBot | MP05780 | Obtained from reseller (B&H and/or Amazon). |
POLYIMIDE TAPE (2" ROLL) | MakerGear | Provided with the printer from MakerGear, though obtainable from a variety of sources. | |
Simplify3D | Simplify3D | Slicer softward used in prints. This software can be purchased from the company, or it can be purchased from MakerGear and other 3D printer makers. |