/

/

לכידת לייזר מיקרודיסציה RNA-רצף לניתוח ביטוי גנים ספציפי רקמה מרחבית וזמנית בצמחים

JoVE Journal
Biology

A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.

JoVE Journal Biology

Laser-Capture Microdissection RNA-Sequencing for Spatial and Temporal Tissue-Specific Gene Expression Analysis in Plants

Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

לכידת לייזר מיקרודיסציה RNA-רצף לניתוח ביטוי גנים ספציפי רקמה מרחבית וזמנית בצמחים

DOI:

10.3791/61517-v

•

08:33 min

•

August 05, 2020

•

Lim Chee Liew², Yan Wang², Marta Peirats-Llobet, Oliver Berkowitz^2,3, James Whelan^2,3, Mathew G. Lewsey³

¹Department of Animal, Plant and Soil Science, AgriBio Building,La Trobe University, ²Australian Research Council Centre of Excellence in Plant Energy Biology,La Trobe University, ³Australian Research Council Research Hub for Medicinal Agriculture, AgriBio Building,La Trobe University

Chapters

00:04Introduction
01:11Tissue Fixation
01:47Tissue Processing
02:38Paraffin Embedding
03:21Polyethylene Naphthalate (PEN) Membrane Slide Preparation
03:49Sectioning
04:53Laser-Capture Microdissection (LCM)
06:14Results: Representative LCM Sample Acquisition and RNA Quantification
07:52Conclusion

Summary

Automatic Translation

מוצג כאן פרוטוקול עבור microdissection לכידת לייזר (LCM) של רקמות צמח. LCM היא טכניקה מיקרוסקופית לבידוד אזורים של רקמות באופן ללא זיהום. ההליך כולל קיבעון רקמות, הטמת פרפין, מקטע, LCM וחילוץ RNA. RNA משמש במורד הזרם ספציפי רקמה, ניתוח נפתר זמנית של transcriptomes.

Tags

Laser-capture Microdissection RNA-sequencing Spatial Transcriptome Temporal Transcriptome Plant Cells Paraffin Embedding Barley Seed Vacuum Infiltration Dehydration Xylene Paraffin Infiltration

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

לייזר Microdissection לכידה של רקמות היונקים

הכנת ראשי בתרביות תאים hematopoietic ממח העצם Murine עבור electroporation

Vaccinia זיהום בנגיף וניתוח הזמני של ביטוי גנים וירוס: חלק 1

Vaccinia זיהום בנגיף וניתוח הזמני של ביטוי גנים וירוס: חלק 2

Vaccinia זיהום בנגיף וניתוח הזמני של ביטוי גנים וירוס: חלק 3

שימוש ג'ין Pulser מערכת MXcell electroporation כדי Transfect תאים ראשוניים עם יעילות גבוהה

שימוש מונה תא אוטומטי כדי לפשט את הביטוי מחקרים ג'ין: siRNA מציאה הביטוי IL 4-Gene תלויים תאים Namalwa

ב הכינון במבחנה של ט פעילים castaneum שהטלומרז

ניתוח של גלובל RNA סינתזה ברמת התא בודד הבאות היפוקסיה

מדידה של קצב חילוף החומרים ב<em> דרוזופילה</em> באמצעות Respirometry

Read Article