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Articolo metodologico

Uso della microscopia time-lapse e della deplezione nucleare stadio-specifica delle proteine per studiare la meiosi in S. cerevisiae

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DOI:

10.3791/64580

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11 ottobre 2022

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* These authors contributed equally

In questo articolo

Sommario

La microscopia time-lapse è uno strumento prezioso per studiare la meiosi nel lievito in erba. Questo protocollo descrive un metodo che combina la sincronizzazione del ciclo cellulare, la microscopia time-lapse e l'esaurimento condizionale di una proteina bersaglio per dimostrare come studiare la funzione di una proteina specifica durante la segregazione cromosomica meiotica.

Abstract

La microscopia a fluorescenza time-lapse ha rivoluzionato la comprensione degli eventi del ciclo cellulare meiotico fornendo dati temporali e spaziali che spesso non vengono visualizzati dalle cellule fisse di imaging. Il lievito in erba ha dimostrato di essere un importante organismo modello per studiare la segregazione cromosomica meiotica perché molti geni meiotici sono altamente conservati. La microscopia time-lapse della meiosi nel lievito in erba consente il monitoraggio di diversi mutanti meiotici per mostrare come la mutazione interrompe i processi meiotici. Tuttavia, molte proteine funzionano in più punti della meiosi. L'uso di mutanti nulli meiotici o con perdita di funzione può quindi interrompere un processo precoce, bloccando o disturbando il processo successivo e rendendo difficile determinare i fenotipi associati a ciascun singolo ruolo. Per aggirare questa sfida, questo protocollo descrive come le proteine possono essere impoverite condizionatamente dal nucleo in fasi specifiche della meiosi mentre monitorano gli eventi meiotici usando la microscopia time-lapse. In particolare, questo protocollo descrive come le cellule sono sincronizzate nella profase I, come la tecnica dell'ancoraggio viene utilizzata per esaurire le proteine dal nucleo in specifici stadi meiotici e come l'imaging time-lapse viene utilizzato per monitorare la segregazione cromosomica meiotica. Come esempio dell'utilità della tecnica, la proteina cinetocoora Ctf19 è stata impoverita dal nucleo in diversi punti temporali durante la meiosi e il numero di masse di cromatina è stato analizzato alla fine della meiosi II. Nel complesso, questo protocollo può essere adattato per esaurire diverse proteine nucleari dal nucleo mentre si monitorano le divisioni meiotiche.

Introduzione

La microscopia a fluorescenza time-lapse è un valido strumento per studiare la dinamica della segregazione cromosomica meiotica nel lievito in erba 1,2. Le cellule di lievito in erba possono essere indotte a subire meiosi attraverso la fame di nutrienti chiave3. Durante la meiosi, le cellule subiscono un ciclo di segregazione cromosomica seguito da due divisioni per creare quattro prodotti meiotici che vengono confezionati in spore (Figura 1). Le singole cellule possono essere visualizzate durante ogni fase della meiosi, che genera dati spaziali e temporali....

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Protocollo

1. Preparazione dei materiali necessari

  1. Preparare i reagenti per la crescita e la sporulazione delle cellule di lievito.
    NOTA: Se i ceppi di lievito in erba sono ade2- e trp1-, integrare tutti i terreni nei punti 1.1.1-1.1.3 con una concentrazione finale dello 0,01% di adenina e dello 0,01% di triptofano dall'1% di stock. Se i mezzi di sterilizzazione in autoclave, aggiungere questi aminoacidi solo dopo che i reagenti sono stati autoclavati e lasciati raffreddare a temperatura ambiente.
    1. Per la crescita vegetativa, preparare 2x mezzo completo + destrosio sintetico (2XSC) sciogliendo 6,7 g di base azotata di lievito....

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Risultati

Per monitorare la segregazione della cromatina, la proteina istonica Htb2 è stata etichettata con mCherry. Nella profase I, la cromatina appare come una singola massa di Htb2. Dopo che i cromosomi omologhi si segregano nella prima divisione meiotica, la cromatina appare come due masse distinte (Figura 3A). Dopo che i cromatidi fratelli si separano, la cromatina appare come quattro masse. Se alcuni cromosomi non riescono ad attaccarsi ai microtubuli del fuso, si possono vedere masse aggiuntiv.......

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Discussione

Questo protocollo combina il sistema NDT80-in per sincronizzare le cellule, la tecnica di ancoraggio per esaurire le proteine dal nucleo e la microscopia time-lapse a fluorescenza per visualizzare le cellule di lievito in erba durante la meiosi. Il sistema NDT80-in è un metodo per la sincronizzazione del ciclo cellulare meiotico che utilizza un arresto e rilascio di profase I 4,8. Sebbene le singole cellule varino leggermente nella quantità di t.......

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Dichiarazioni

Gli autori non dichiarano interessi finanziari concorrenti.

Ringraziamenti

Ringraziamo il Light Microscopy Imaging Center dell'Università dell'Indiana. Questo lavoro è stato sostenuto da una sovvenzione del National Institutes of Health (GM105755).

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Materiali

Elenco dei materiali utilizzati in questo articolo
NomeAziendaNumero di catalogoCommenti
β-estradioloMillipore SigmaE8875Produci 1 mM di azioni in 95% EtOH
0,22 uM Filtro filettato per bottiglieMillipore SigmaS2GPT02RE
100% EtOHFisher Scientific22-032-601
10X PBSFisher ScientificBP399500Diluire 1:10 da utilizzare come solvente per
ConA 24 mm x 50 mm vetrino coprioggetti n. 1,5VWR Vetriniper
nordamericani 25 mm x 75 mmVWR Nord America48300-026
Sale di adenina emisolfatoMillipore SigmaA9126Per integrare SC, SCA e 1% Kac
Bacto AgarBD214030
Concanavialina AMllipore SigmaC2010Fare come 1mg/mL in 1X PBS
CoolSNAP HQ2 CCD cameraFotometriautilizzata nella sezione 4.3
D-glucosioFisher ScientificD16-10
Difco Lievito Base azotata senza aminoacidiBD291920
Dimetil solfossido (DMSO)Millipore SigmaD5879
Eclipse Ti2 microscopio a obiettivo invertitoNikonUtilizzato nella sezione 4.4
FijiNIHScarica da https://fiji.sc/
GE Personal DeltaVision MicroscopeApplied PrecisionUsed in Section 4.3
L-Tryptophen Millipore SigmaT0254Per integrare SC, SCA e 1% Kac
Modeling ClayCrayola  2302880000Per fissare il vetrino coprioggetti nel supporto per vetrini
NIS-Elements AR 5.30.04 Software di imagingNikonUtilizzato nella sezione 4.4
ORCA-Fustion BT CameraHamamatsuC15440-20UPUtilizzato nella sezione 4.4
Supporto per puntali per pipette in plasticaDot ScientificLTS1000-HRTagliare una sezione di 4 quadrati x 4 quadrati della parte del rack di questo prodotto.
Acetato di PottassioFisher ScientificBP264
RapamicinaFisher ScientificBP29631Produce scorte da 1 mg/mL in DMSO
Sigillante siliconicoAqueon100165001Conosciuto anche come colla per acquari.
SoftWorx7.0.0  Software di imagingapplicato di precisioneutilizzato nella sezione 4.3
Miscela completa sintetica (Kaiser) Per olio da immersione di tipo N a medioDSCK2500
NikonMXA22166
microscopio 48393241

Riferimenti

  1. Tsuchiya, D., Gonzalez, C., Lacefield, S. The spindle checkpoint protein Mad2 regulates APC/C activity during prometaphase and metaphase of meiosis I in Saccharomyces cerevisiae. Molecular Biology of the Cell. 22 (16), 2848-2861 (2011).
  2. Cairo, G., MacKenzie, A. M., Lacefield, S.

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