שיטות מתוארות ליצירת כמויות גדולות של אדנו-וירוסים רקומביננטיים, אשר לאחר מכן ניתן להשתמש בהם כדי להתמיר את המכרסם המקומי urothelium המאפשר ביטוי של transgenes או downregulation של תוצרי גנים אנדוגניים.
בנוסף ליצירת מחסום בעל התנגדות גבוהה, משערים כי השתן המצפה את אגן הכליה, השופכנים, שלפוחית השתן והשופכה הפרוקסימלית חש ומעביר מידע על סביבתו לרקמות שמתחתיו, ומקדם תפקוד והתנהגות של התרוקנות. הפרעה במחסום דרכי השתן, או בתפקוד החושי/מתמר שלו, עלולה להוביל למחלה. חקר האירועים המורכבים האלה נפגע בשל היעדר אסטרטגיות פשוטות לשינוי ביטוי גנים וחלבונים באורותל. מתוארות כאן שיטות המאפשרות לחוקרים לייצר כמויות גדולות של אדנו-וירוס בעל טיטר גבוה, אשר לאחר מכן ניתן להשתמש בו כדי להפוך מכרסם אורותל ביעילות גבוהה, ובאופן פשוט יחסית. הן cDNA והן RNA מפריע קטן יכולים לבוא לידי ביטוי באמצעות התמרה אדנו-ויראלית, ואת ההשפעה של ביטוי טרנסגנים על תפקוד דרכי השתן ניתן להעריך 12 שעות עד כמה ימים מאוחר יותר. לשיטות אלה ישימות רחבה במחקרים של ביולוגיה נורמלית ולא תקינה של דרכי השתן באמצעות מודלים של חיות עכבר או חולדה.
האורותל הוא אפיתל מיוחד המרפד את אגן הכליה, השופכנים, שלפוחית השתן והשופכה הפרוקסימלית1. הוא מורכב משלוש שכבות: שכבה של תאי מטריה ממוינים ומקוטבים מאוד, לעתים קרובות דו-גרעיניים, שפני השטח האפיקליים שלהם שטופים בשתן; שכבת תאי ביניים עם אוכלוסייה של תאים מגבירי מעבר דו-גרעיניים שיכולים ליצור תאי מטריה שטחיים בתגובה לאובדנם החריף; ושכבה אחת של תאי בסיס, תת-קבוצה שלהם מתפקדים כתאי גזע שיכולים לחדש את כל דרכי השתן בתגובה לפגיעה כרונית. תאי מטריה אחראים בעיקר ליצירת מחסום דרכי השתן בעל העמידות הגבוהה, שמרכיביו כוללים קרום אפיקלי (עשיר בכולסטרול וצרברוזידים) בעל חדירות נמוכה למים ולמומסים, וקומפלקס צמתים אפיקלי בעל עמידות גבוהה (המורכב מצמתים הדוקים, צמתים נצמדים, דסמוזומים וטבעת אקטומיוזין קשורה)1 . הן פני השטח האפיקליים של תא המטריה והן טבעת הצומת שלו מתרחבים במהלך מילוי שלפוחית השתן וחוזרים למצבם המלא מראש במהירות לאחר התרוקנות 1,2,3,4,5. בנוסף לתפקידו בתפקוד המחסום, משערים כי לאורותלים יש גם תפקודי חישה ומתמרים המאפשרים לו לחוש שינויים בסביבה החוץ-תאית (למשל, מתיחה) ולהעביר מידע זה באמצעות שחרור מתווכים (כולל ATP, אדנוזין ואצטילכולין) לרקמות הבסיסיות,כולל תהליכים עצביים תת-אורותליים 6,7,8 . עדויות עדכניות לתפקיד זה נמצאות בעכברים חסרי ביטוי דרכי השתן הן של Piezo1 והן של Piezo2, מה שגורם לשינוי בפונקציית ההתרוקנות9. בנוסף, חולדות המבטאות יתר על המידה את החלבון CLDN2 יוצר הנקבוביות בשכבת תאי המטריה מפתחות דלקת וכאב דומים לאלה שנצפו בחולים עם דלקת שלפוחית השתן אינטרסטיציאלית10. משערים כי הפרעה בתפקוד החושי/מתמר או מחסום דרכי השתן עשויה לתרום למספר הפרעות בשלפוחית השתן 6,11.
הבנה טובה יותר של הביולוגיה של השתן במצבים נורמליים ובמצבי מחלה תלויה בזמינותם של כלים שיאפשרו לחוקרים להפחית בקלות את ביטוי הגנים האנדוגניים או לאפשר ביטוי של טרנסגנים ברקמה הטבעית. בעוד שגישה אחת להפחתת ויסות ביטוי גנים היא יצירת עכברי נוקאאוט מותנים של דרכי השתן, גישה זו תלויה בזמינות של עכברים עם אללים פלוקסדיים, היא אינטנסיבית ויכולה להימשך חודשים עד שנים כדי להשלים12. באופן לא מפתיע, אם כן, חוקרים פיתחו טכניקות להדביק או להתמיר את האורותל, מה שיכול להוביל לתוצאות בטווח זמן קצר יותר. שיטות שפורסמו לטרנספקציה כוללות שימוש בשומנים קטיוניים13, אוליגודאוקסינוקלאוטידים אנטי-סנס 14, או חומצות גרעין אנטיסנס הקשורות לחלבון HIV TAT החודר לפפטיד 11-mer15. עם זאת, המוקד של פרוטוקול זה הוא על השימוש בטרנסדוקציה בתיווך אדנובירל, מתודולוגיה נחקרת היטב היעילה בהעברת גנים למגוון רחב של תאים, נבדקה בניסויים קליניים רבים, ולאחרונה שימשה להעברת cDNA המקודד את חלבון הקפסיד COVID-19 למקבלי גרסה אחת של חיסון COVID-1916, 17. לתיאור מעמיק יותר של מחזור החיים של אדנווירוס, וקטורים אדנו-ויראליים ויישומים קליניים של אדנווירוסים, הקורא מופנה להפניה17.
אבן דרך חשובה בשימוש באדנו-וירוסים להעברת האורותל, הייתה דו”ח של Ramesh et al. שהראה טיפולים מקדימים קצרים עם דטרגנטים, כולל N-dodecyl-β-D-maltoside (DDM) שיפור דרמטי בהתמרה של האורותליום על ידי אדנווירוס המקודד β-גלקטוזידאז18. באמצעות מחקר הוכחת עיקרון זה כמדריך, התמרה בתיווך אדנובירל של האורותליום שימשה כעת לביטוי מגוון חלבונים, כולל GTPases ממשפחת ראב, גורמי חילוף גואנין-נוקלאוטידים, שברי מנוע מיוזין, קלאודינים הקשורים לצומת הדוק יוצרי נקבוביות, ו- ADAM17 10,19,20,21,22 . אותה גישה הותאמה לבטא רנ”א מפריע קטן (siRNA), שהשפעותיו ניצלו על ידי ביטוי משותף של גרסאות עמידות ל-siRNA של הטרנסגן22. הפרוטוקול המתואר כאן כולל שיטות כלליות ליצירת כמויות גדולות של אדנו-וירוס מרוכז מאוד, דרישה לטכניקות אלה, כמו גם התאמות של השיטות של Ramesh et al.18 כדי לבטא טרנסגנים באורותליום ביעילות גבוהה.
בעוד ראמש ועמיתיו התמקדו בפיתוח אסטרטגיות לשימוש בהתמרה אדנו-ויראלית בטיפול בסרטן שלפוחית השתן 18, דיווחים עדכניים יותר הדגימו את התועלת של טכניקות אלה בחקר ביולוגיה / פיזיולוגיה של דרכי השתן ופתופיזיולוגיה תקינה 10,18,19,20,21…
The authors have nothing to disclose.
עבודה זו נתמכה על ידי פרס פרויקט פיילוט באמצעות P30DK079307 (ל- M.G.D.), מענק NIH R01DK119183 (ל- G.A. ו- M.D.C.), מענק NIH R01DK129473 (ל- G.A.), פרס פיתוח קריירה של האגודה האמריקאית לאורולוגיה ומענק קרן וינטרס (ל- N.M.), על ידי פיזיולוגיה של התא וליבות הדמיית כליות של אורגניזמים מודל של מרכז פיטסבורג לחקר הכליות (P30DK079307), ועל ידי S10OD028596 (ל-G.A.), שמימנה את רכישת המערכת הקונפוקלית ששימשה ללכידת חלק מהתמונות המוצגות בכתב יד זה.
10 mL pipette | Corning Costar (Millipore Sigma) | CLS4488 | sterile, serological pipette, individually wrapped |
12 mL ultracentrifuge tube | ThermoFisher | 06-752 | PET thinwall ultracentrifuge tube |
15 mL conical centrifuge tube | Falcon (Corning) | 352097 | sterile |
18 G needle | BD | 305196 | 18 G x 1.5 in needle |
20 mL pipette | Corning Costar (Millipore Sigma) | CLS4489 | sterile, serological pipette, individually wrapped |
50 mL conical centrifuge tube | Falcon (Corning) | 352098 | sterile |
5 mL pipette | Corning Costar (Millipore Sigma) | CLS4487 | sterile, serological pipette, individually wrapped |
Cavicide | Henry Schein | 6400012 | Anti-viral solution |
Cell culture dish – 15 cm | Falcon (Corning) | 353025 | sterile, tissue-culture treated (150 mm x 25 mm dish) |
Cell scraper | Sarstedt | 893.1832 | handle length 24 cm, blade length 1.7 cm |
CsCl | Millipore Sigma | C-4306 | Molecular Biology grade ≥ 98% |
DMEM culture medium (high glucose) | Gibco (ThermoFisher) | 11965092 | with 4.5 g/L glucose + L-glutamine + phenol red |
EDTA | Millipore Sigma | EDS | Bioiultra grade ≥ 99% |
Fetal bovine serum | Hyclone (Cytiva) | SH30070.03 | defined serum |
Glass pipette | Fisher Scientific | 13-678-20A | 5.75 in glass pipette, autoclaved |
Glycerol | Millipore Sigma | G-5516 | Molecular Biology grade ≥ 99% |
HEK293 cells | ATCC | CRL-3216 | HEK293T cells are a variant of HEK293 cells that express the SV40 large T-antigen |
Isoflurane | Covetrus | 29405 | |
IV catheter – mouse | Smith Medical Jelco | 3063 | 24 G x 3/4 in Safety IV catheter radiopaque |
IV catheter – rat | Smith Medical Jelco | 3060 | 22 G x 1 in Safety IV catheter radiopaque |
KCl | Millipore Sigma | P-9541 | Molecular Biology grade ≥ 99% |
KH2PO4 | Millipore Sigma | P5655 | Cell culture grade ≥ 99% |
Na2HPO4•7 H2O | Millipore Sigma | 431478 | ≥ 99.99% |
NaCl | Millipore Sigma | S3014 | Molecular Biology grade ≥ 99% |
N-dodecyl-β-D-maltoside | Millipore Sigma | D4641 | ≥ 98% |
Nose cone for multiple animals | custom designed | commercial options include one from Parkland Scientific (RES3200) | |
PD-10 column | GE Healthcare | 17-085-01 | Prepacked columns filled ith Sephadex G-25M |
Penicillin/streptomycin antibiotic (100x) | Gibco (ThermoFisher) | 15070063 | 100x concentrated solution |
Spectrophotometer | Eppendorf | BioPhotometer | |
Stand and clamp | Fisher Scientific | 14-679Q and 05-769-8FQ | available from numerous suppliers |
Sterile filter unit | Fisher Scientific (Nalgene) | 09-740-65B | 0.2 µm rapid-flow filter unit (150 mL) |
Sterile filter unit 0.2 µm (syringe) | Fisher Scientific | SLGV004SL | Millipore Sigma Milex 0.22 µm filter unit that attaches to syringe |
Super speed centrifuge | Eppendorf | 5810R | with Eppendorf F34-6-38 fixed angle rotor (12,000 rpm) |
Syringe (1 mL) | BD | 309628 | 1-mL syringe Luer-lok tip – sterile |
Syringe (3 mL) | BD | 309656 | 3-mL syringe slip tip – sterile |
Table-top centrifuge (low speed) | Eppendorf | 5702 | with swinging bucket rotor |
Transfer pipettes | Fisher Scientific | 13-711-9AM | polyethylene 3.4 mL transfer pipette |
Tris-base | Millipore Sigma | 648310-M | Molecular Biology grade |
TrypLE select protease solution | Gibco (ThermoFisher) | 12604013 | TrypLE express enzyme (1x), no phenol red |
Ultracentrifuge | Beckman Coulter | Optima L-80 XP | with Beckman SW41 rotor (41,000 rpm) |
Vaporizer | General Anesthetic Services, Inc. | Tec 3 | Isoflurane vaporizer |
Vortex Mixer | VWR | 10153-838 | analog vortex mixer |