Summary

Subcellulär avbildning av neuronal kalciumhantering in vivo

Published: March 17, 2023
doi:

Summary

De nuvarande metoderna beskriver en icke-ratiometrisk metod för högupplöst, subkompartmentell kalciumavbildning in vivo i Caenorhabditis elegans med hjälp av lättillgängliga genetiskt kodade kalciumindikatorer.

Abstract

Kalcium (Ca2+) avbildning har till stor del använts för att undersöka neuronal aktivitet, men det blir allt tydligare att subcellulär Ca2 + hantering är en avgörande komponent i intracellulär signalering. Visualiseringen av subcellulär Ca2+ dynamik in vivo, där neuroner kan studeras i sina infödda, intakta kretsar, har visat sig vara tekniskt utmanande i komplexa nervsystem. Transparensen och det relativt enkla nervsystemet hos nematoden Caenorhabditis elegans möjliggör cellspecifikt uttryck och in vivo-visualisering av fluorescerande taggar och indikatorer. Bland dessa är fluorescerande indikatorer som har modifierats för användning i cytoplasman såväl som olika subcellulära fack, såsom mitokondrier. Detta protokoll möjliggör icke-ratiometrisk Ca 2+ avbildning in vivo med en subcellulär upplösning som möjliggör analys av Ca2+ dynamik ner till nivån för enskilda dendritiska ryggar och mitokondrier. Här används två tillgängliga genetiskt kodade indikatorer med olika Ca 2+ affiniteter för att demonstrera användningen av detta protokoll för att mäta relativa Ca2+ nivåer inom cytoplasman eller mitokondriell matris i ett enda par excitatoriska interneuroner (AVA). Tillsammans med de genetiska manipulationer och longitudinella observationer som är möjliga i C. elegans kan detta avbildningsprotokoll vara användbart för att svara på frågor om hur Ca2+ hantering reglerar neuronal funktion och plasticitet.

Introduction

Kalciumjoner (Ca2+) är mycket mångsidiga bärare av information i många celltyper. I neuroner är Ca2+ ansvarig för den aktivitetsberoende frisättningen av neurotransmittorer, regleringen av cytoskeletal motilitet, finjustering av metaboliska processer, liksom många andra mekanismer som krävs för korrekt neuronalt underhåll och funktion 1,2. För att säkerställa effektiv intracellulär signalering måste neuroner upprätthålla låga basala Ca2+ nivåer i sin cytoplasma3. Detta uppnås genom kooperativa Ca 2+ hanteringsmekanismer, inklusive upptag av Ca2+ i organeller såsom endoplasmatisk retikulum (ER) och mitokondrier. Dessa processer, förutom arrangemanget av Ca2+-permeabla jonkanaler i plasmamembranet, resulterar i heterogena nivåer av cytoplasmatiskCa2+ i hela neuronen.

Ca 2+ heterogenitet under vila och neuronal aktivering möjliggör mångfaldig, platsspecifik reglering av Ca2+-beroende mekanismer 1. Ett exempel på de koncentrationsspecifika effekterna av Ca 2+ är frisättningen av Ca2+ från ER genom inositol 1,4,5-trisfosfat (InsP3) receptorer. Låga Ca2+ nivåer i kombination med InsP3 krävs för öppning av receptorns kalciumpermeabla porer. Alternativt hämmar höga Ca2+ nivåer både direkt och indirekt receptorn4. Betydelsen av Ca 2+ homeostas för korrekt neuronal funktion stöds av bevis som tyder på att störd intracellulär Ca2+ hantering och signalering är ett tidigt steg i patogenesen av neurodegenerativa störningar och naturligt åldrande 5,6. Specifikt är onormalt upptag och frisättning av Ca2+ av ER och mitokondrier kopplade till uppkomsten av neuronal dysfunktion vid Alzheimers sjukdom, Parkinsons sjukdom och Huntingtons sjukdom 6,7.

Studien av Ca 2+ dyshomeostas under naturligt åldrande eller neurodegeneration kräver longitudinell observation av Ca2+ nivåer med subcellulär upplösning i en levande, intakt organism där den ursprungliga cellulära arkitekturen (dvs arrangemanget av synapser och distribution av jonkanaler) upprätthålls. För detta ändamål ger detta protokoll vägledning om användningen av två lättillgängliga, genetiskt kodade Ca 2+ sensorer för inspelning av Ca2+ dynamik in vivo med hög rumslig och tidsmässig upplösning. De representativa resultaten som förvärvats med den beskrivna metoden i C. elegans visar hur uttrycket av Ca 2+ indikatorer i cytoplasman eller mitokondriell matris av enskilda neuroner kan möjliggöra snabb förvärv av fluorescerande bilder (upp till 50 Hz) som illustrerar Ca 2+ dynamiken med den ytterligare förmågan att urskilja Ca 2+ nivåer inom enskilda ryggradsliknande strukturer och individuella mitokondrier.

Protocol

1. Skapa transgena stammar Med hjälp av valfri kloningsmetod8,9 ska klonuttrycksvektorer innehålla promotorn Pflp-18 eller Prig-3 (för AVA-specifik signal i den ventrala nervkabeln), följt av valfri Ca2+-indikator, och sedan en 3′ UTR (se diskussionen för mer information)10. En förteckning över plasmider och deras källor finns i kompletterande tabell 1. …

Representative Results

Dessa två protokoll möjliggör snabb förvärv av differentiella Ca2+ nivåer inom de subcellulära regionerna och organellerna hos enskilda neuriter in vivo med hög rumslig upplösning. Det första protokollet möjliggör mätning av cytoplasmatisk Ca2+ med hög tidsmässig och rumslig upplösning. Detta demonstreras här med hjälp av det cellspecifika uttrycket av GCaMP6f i glutamaterga AVA-kommandointerneuroner15, vars neuriter löper hela längden av den vent…

Discussion

Det första övervägandet vid implementering av den beskrivna metoden innefattar val av en Ca2+ indikator med ideala egenskaper för den givna forskningsfrågan. Cytoplasmatiska Ca 2+ indikatorer har vanligtvis en hög affinitet för Ca 2+, och känsligheten hos dessa indikatorer för Ca 2+ är omvänt relaterad till kinetiken (på / av-hastighet) 16,17. Detta innebär att antingen Ca2+ känslighet eller kin…

Divulgazioni

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Detta arbete stöddes av National Institutes of Health (NIH) (R01- NS115947 tilldelad F. Hoerndli). Vi vill också tacka Dr. Attila Stetak för plasmiden pAS1.

Materials

100x/1.40 Oil objective   Olympus   UPlanSApo
10x/0.40 Objective  Olympus   UPlanSApo
22 mm x 22 mm Cover glass  VWR  48366-227 
Agarose SFR  VWR  J234-100G 
Beam homogenizer Andor Technologies Borealis upgrade to CSU-X1
CleanBench laboratory table  TMC  With vibration control
Disposable culture tubes VWR  47729-572  13 mm x 100 mm
Environmental chamber Thermo Scientific 3940 Set to 20 °C
Filter wheel or slider ASI For 25 mm diameter filters
FJH 185 Caenorhabditis Genetics Center  FJH 185 Worm strain
FJH 597 Caenorhabditis Genetics Center FJH 597 Worm strain
GFP bandpass emission filter  Chroma  525 ± 50 nm (25 mm diameter)
ILE laser combiner  Andor Technologies  4 laser lines 
ILE solid state 488 nm laser Andor Technologies  50 mW
ImageJ National Institutes of Health Version 1.52a
IX83 Spinning disk confocal microscope  Olympus  With Yokogawa CSU-X1 spinning disc
iXon Ultra EMCCD camera  Andor Technologies 
Low auto-fluorescence immersion oil  Olympus  Z-81226
MetaMorph  Molecular Devices  Version 7.10.1 
Microscope control box Olympus IX3-CBH
Muscimol  MP Biomedical / Sigma 02195336-CF 
pAS1 AddGene 194970 Plasmid
pBSKS Stratagene
pCT61 Plasmid available from Hoerndli/Maricq lab upon request
pJM23 Plasmid available from Hoerndli/Maricq lab upon request
pKK1  AddGene  194969 Plasmid
Polybead microspheres  Polysciences Inc.  00876-15  0.094 µm
Stability chamber Norlake Scientific NSRI241WSW/8H Set to 15 °C
Stage controller ASI With filter wheel control
Standard microscope slide Premiere 9108W-E 75 mm x 25 mm x 1 mm
Touch panel controller Olympus I3-TPC
Z-drift corrector  Olympus  IX3-ZDC2

Riferimenti

  1. Berridge, M. J. Neuronal calcium signaling. Neuron. 21 (1), 13-26 (1998).
  2. Brini, M., Calì, T., Ottolini, D., Carafoli, E. Neuronal calcium signaling: Function and dysfunction. Cellular and Molecular Life Sciences. 71 (15), 2787-2814 (2014).
  3. Brini, M., Calì, T., Ottolini, D., Carafoli, E. Intracellular calcium homeostasis and signaling. Metal Ions in Life Sciences. 12, 119-168 (2013).
  4. Berridge, M. J. The inositol trisphosphate/calcium signaling pathway in health and disease. Physiological Reviews. 96 (4), 1261-1296 (2016).
  5. Schrank, S., Barrington, N., Stutzmann, G. E. Calcium-handling defects and neurodegenerative disease. Cold Spring Harbor Perspectives in Biology. 12 (7), 035212 (2020).
  6. Pchitskaya, E., Popugaeva, E., Bezprozvanny, I. Calcium signaling and molecular mechanisms underlying neurodegenerative diseases. Cell Calcium. 70, 87-94 (2018).
  7. Jadiya, P., et al. Impaired mitochondrial calcium efflux contributes to disease progression in models of Alzheimer’s disease. Nature Communications. 10 (1), 3885 (2019).
  8. Zeiser, E., Frøkjær-Jensen, C., Jorgensen, E., Ahringer, J. MosSCI and gateway compatible plasmid toolkit for constitutive and inducible expression of transgenes in the C. elegans germline. PLoS One. 6 (5), 20082 (2011).
  9. Zhu, B., Cai, G., Hall, E. O., Freeman, G. J. In-FusionTM assembly: Seamless engineering of multidomain fusion proteins, modular vectors, and mutations. Biotechniques. 43 (3), 354-359 (2007).
  10. Evans, T. C. Transformation and Microinjection. WormBook. , (2006).
  11. Giordano-Santini, R., Dupuy, D. Selectable genetic markers for nematode transgenesis. Cellular and Molecular Life Sciences. 68 (11), 1917-1927 (2011).
  12. Stiernagle, T. Maintenance of C. elegans. WormBook. , (2006).
  13. Stiernagle, T. Maintenance of C. elegans: Transferring worms grown on NGM plates. WormBook. , (2006).
  14. Ogama, T. A beginner’s guide to improving image acquisition in fluorescence microscopy. The Biochemist. 42 (6), 22-27 (2020).
  15. Mellem, J. E., Brockie, P. J., Madsen, D. M., Maricq, A. v. Action potentials contribute to neuronal signaling in C. elegans. Nature Neuroscience. 11 (8), 865-867 (2009).
  16. Zhang, Y., et al. Fast and sensitive GCaMP calcium indicators for imaging neural populations. bioRxiv. , (2021).
  17. Kerruth, S., Coates, C., Dürst, C. D., Oertner, T. G., Török, K. The kinetic mechanisms of fast-decay red-fluorescent genetically encoded calcium indicators. Journal of Biological Chemistry. 294 (11), 3934-3946 (2019).
  18. de Juan-Sanz, J., et al. Axonal endoplasmic reticulum Ca2+ content controls release probability in CNS nerve terminals. Neuron. 93 (4), 867-881 (2017).
  19. Fung, W., Wexler, L., Heiman, M. G. Cell-type-specific promoters for C. elegans glia. Journal of Neurogenetics. 34 (3-4), 335-346 (2020).
  20. Ali, F., Kwan, A. C. Interpreting in vivo calcium signals from neuronal cell bodies, axons, and dendrites: a review. Neurophotonics. 7 (1), 011402 (2019).
  21. Tian, L., et al. Imaging neural activity in worms, flies and mice with improved GCaMP calcium indicators. Nature Methods. 6 (12), 875-881 (2009).
  22. Mank, M., et al. A genetically encoded calcium indicator for chronic in vivo two-photon imaging. Nature Methods. 5 (9), 805-811 (2008).
  23. Birkner, A., Tischbirek, C. H., Konnerth, A. Improved deep two-photon calcium imaging in vivo. Cell Calcium. 64, 29-35 (2017).
  24. Ryan, K. C., Laboy, J. T., Norman, K. R. Deregulation of mitochondrial calcium handling due to presenilin loss disrupts redox homeostasis and promotes neuronal dysfunction. Antioxidants. 11 (9), 1642 (2022).
  25. Yang, H. H., et al. Subcellular imaging of voltage and calcium signals reveals neural processing in vivo. Cell. 166 (1), 245-257 (2016).
  26. Takahashi, N., Oertner, T. G., Hegemann, P., Larkum, M. E. Active cortical dendrites modulate perception. Science. 354 (6319), 1587-1590 (2016).
  27. Nicoletti, M., et al. Biophysical modeling of C. elegans neurons: Single ion currents and whole-cell dynamics of AWCon and RMD. PLoS One. 14 (7), 0218738 (2019).
  28. Church, P. J., Stanley, E. F. Single L-type calcium channel conductance with physiological levels of calcium in chick ciliary ganglion neurons. The Journal of Physiology. 496, 59-68 (1996).
  29. O’Hare, J. K., et al. Compartment-specific tuning of dendritic feature selectivity by intracellular Ca 2+ release. Science. 375 (6586), (2022).
  30. Mclntire, S. L., Jorgensen, E., Horvitz, H. R. Genes required for GABA function in Caenorhabditis elegans. Nature. 364 (6435), 334-337 (1993).
  31. Doser, R. L., Amberg, G. C., Hoerndli, F. J. Reactive oxygen species modulate activity-dependent AMPA receptor transport in C. elegans. The Journal of Neuroscience. 40 (39), 7405-7420 (2020).
  32. Wu, J., et al. A long Stokes shift red fluorescent Ca2+ indicator protein for two-photon and ratiometric imaging. Nature Communications. 5, 5262 (2014).
  33. Cho, J. -. H., et al. The GCaMP-R family of genetically encoded ratiometric calcium indicators. ACS Chemical Biology. 12 (4), 1066-1074 (2017).
  34. Smith, J. J., et al. A light sheet fluorescence microscopy protocol for Caenorhabditis elegans larvae and adults. Frontiers in Cell and Developmental Biology. 10, 1012820 (2022).
  35. Müller, M., et al. Mitochondria and calcium regulation as basis of neurodegeneration associated with aging. Frontiers in Neuroscience. 12, 470 (2018).
  36. Nikoletopoulou, V., Tavernarakis, N. Calcium homeostasis in aging neurons. Frontiers in Genetics. 3, 200 (2012).
  37. Chen, C. -. H., Chen, Y. -. C., Jiang, H. -. C., Chen, C. -. K., Pan, C. -. L. Neuronal aging: Learning from C. elegans. Journal of Molecular Signaling. 8 (1), 14 (2013).
  38. Saberi-Bosari, S., Huayta, J., San-Miguel, A. A microfluidic platform for lifelong high-resolution and high throughput imaging of subtle aging phenotypes in C. elegans. Lab on a Chip. 18 (20), 3090-3100 (2018).
  39. Sridhar, N., Fajrial, A. K., Doser, R. L., Hoerndli, F. J., Ding, X. Surface acoustic wave microfluidics for repetitive and reversible temporary immobilization of C. elegans. Lab on a Chip. 22 (24), 4882-4893 (2022).
check_url/it/64928?article_type=t

Play Video

Citazione di questo articolo
Doser, R., Knight, K. M., Deihl, E., Hoerndli, F. Subcellular Imaging of Neuronal Calcium Handling In Vivo. J. Vis. Exp. (193), e64928, doi:10.3791/64928 (2023).

View Video