Protokollet beskriver hur porfyrinbaserade kompensationspärlor för flödescytometri framställs genom reaktion av aminfunktionaliserade polystyrenpärlor med porfyrin TCPP och amidkopplingsreagenset EDC. Ett filtreringsförfarande används för att minska partikelbiprodukterna.
Flödescytometri kan snabbt karakterisera och kvantifiera olika cellpopulationer baserat på fluorescensmätningar. Cellerna färgas först med ett eller flera fluorescerande reagens, var och en funktionaliserad med en annan fluorescerande molekyl (fluorofor) som binder till celler selektivt baserat på deras fenotypiska egenskaper, såsom cellytans antigenuttryck. Intensiteten av fluorescens från varje reagens bundet till celler kan mätas på flödescytometern med hjälp av kanaler som detekterar ett specificerat våglängdsområde. När flera fluoroforer används spiller ljuset från enskilda fluoroforer ofta över till oönskade detektionskanaler, vilket kräver en korrigering av fluorescensintensitetsdata i en process som kallas kompensation.
Kompensationskontrollpartiklar, vanligtvis polymerpärlor bundna till en enda fluorofor, behövs för varje fluorofor som används i ett cellmärkningsexperiment. Data från kompensationspartiklar från flödescytometern används för att tillämpa en korrigering på fluorescensintensitetsmätningarna. Detta protokoll beskriver beredning och rening av polystyrenkompensationspärlor kovalent funktionaliserade med det fluorescerande reagenset mesotetra (4-karboxifenyl) porfin (TCPP) och deras tillämpning i flödescytometrikompensation. I detta arbete behandlades aminfunktionaliserade polystyrenpärlor med TCPP och amidkopplingsreagenset EDC (N-(3-dimetylaminopropyl)-N′-etylkarbodiimidhydroklorid) vid pH 6 och vid rumstemperatur i 16 timmar med omrörning. TCPP-pärlorna isolerades genom centrifugering och återsuspenderades i en pH 7-buffert för lagring. TCPP-relaterade partiklar observerades som en biprodukt. Antalet av dessa partiklar kan minskas med hjälp av ett valfritt filtreringsprotokoll. De resulterande TCPP-pärlorna användes framgångsrikt på en flödescytometer för kompensation i experiment med humana sputumceller märkta med flera fluoroforer. TCPP-pärlorna visade sig vara stabila efter förvaring i kylskåp i 300 dagar.
Porfyriner har varit av intresse i många år inom det biomedicinska området på grund av deras fluorescens och tumörriktade egenskaper 1,2,3. Terapeutiska tillämpningar såsom fotodynamisk terapi (PDT) och sonodynamisk terapi (SDT) innefattar systemisk administrering av ett porfyrin till en cancerpatient, ackumulering av läkemedlet i tumören och lokaliserad exponering av tumören för ett laserljus med en specifik våglängd eller ultraljud. Exponeringen för laserljus eller ultraljud leder till generering av reaktiva syreradikaler av porfyrinet och efterföljande celldöd 4,5. Vid fotodynamisk diagnos (PDD) används porfyrinfluorescens för att skilja cancerceller från normala celler6. I detta sammanhang används protoporfyrin IX, ett naturligt fluorescerande porfyrin som ackumuleras i tumörer vid systemisk eller lokal injektion av dess föregångare, 5-aminolevulinsyra (5-ALA), för att identifiera gastrointestinala stromatumörer, blåscancer och hjärncancer 7,8. På senare tid undersöktes 5-ALA-behandling som ett tillvägagångssätt för att upptäcka minimal kvarvarande sjukdom i multipelt myelom9. Vårt laboratorium har använt tetraarylporfyrin TCPP (5,10,15,20-tetrakis-(4-karboxifenyl)-21,23 H-porfin) för sin förmåga att selektivt färga lungcancerceller och cancerassocierade celler i humana sputumprover, vilket är en egenskap som har utnyttjats i objektglasbaserade och flödescytometriska diagnostiska analyser10.
Vissa porfyriner är bifunktionella genom att de kan användas som terapeutiska och diagnostiska medel 2,11. I biomedicinsk forskning används sådana bifunktionella porfyriner för att utvärdera hur deras förmåga att selektivt rikta in sig på och döda cancerceller är en funktion av deras struktur samt hur den påverkas av närvaron av andra föreningar 12,13,14,15,16. Både det cellulära upptaget av porfyriner och deras cytotoxicitet kan mätas på en flödescytometrisk plattform på ett sätt med hög genomströmning. Absorptions- och emissionsspektra för fluorescerande porfyriner är komplexa, men de flesta flödescytometriska plattformar är utrustade för att korrekt identifiera dem. Absorptionsspektrumet för fluorescerande porfyriner kännetecknas av ett starkt absorptionsband i intervallet 380-500 nm, känt som Soret-bandet. Två till fyra svagare absorptionsband observeras i allmänhet i intervallet 500–750 nm (Q-band)17. En blå 488 nm laser, närvarande i de flesta flödescytometrar, eller en violett laser (405 nm) kan generera ljus med lämplig våglängd för att excitera porfyriner. Emissionsspektra för porfyriner visar typiskt toppar i 600-800 nm-området18, vilket resulterar i mycket liten spektral överlappning med fluoresceinisotiocyanat eller fykoerytrin (PE) fluoroforer men betydande överlappning med andra ofta använda fluoroforer, såsom allophycocyanin (APC), liksom tandemfluoroforer, såsom PE-Cy5 och andra. Vid användning av porfyriner i flerfärgsflödescytometrianalyser är därför enkelfluoroforkontroller väsentliga för att på ett adekvat sätt korrigera spridningen av fluorescens i andra kanaler än den som är avsedd att mäta porfyrinets fluorescens.
Helst bör de enkelfluoroforkontroller som används för att beräkna spridningsmatrisen för en panel av fluoroforer (även kallade kompensationskontroller) bestå av samma celltyp(er) som provet. Att använda provet för detta ändamål är dock inte optimalt om det finns mycket lite prov till att börja med eller om målpopulationen inom provet är mycket liten (till exempel om man vill titta på minimal kvarvarande sjukdom eller cancerceller i de tidiga stadierna av sjukdomen). Ett användbart alternativ till celler är pärlor i kombination med samma fluorofor som används för att analysera provet. Många sådana pärlor är kommersiellt tillgängliga; Dessa pärlor är antingen förmärkta med önskad fluorofor (förmärkta fluoroforspecifika pärlor)19,20, eller en fluorescerande märkt antikropp kan fästas på dem (antikroppsfångande pärlor)20,21. Medan kommersiella kompensationspärlor är tillgängliga för många fluoroforer, är sådana pärlor inte tillgängliga för porfyriner, trots deras ökande användning i grundforskning och klinisk forskning.
Förutom provbevarande och positivt kontra negativa populationer av lämplig storlek är de andra fördelarna med att använda pärlor som kompensationskontroller enkel förberedelse, låg bakgrundsfluorescens och utmärkt stabilitet över tid22. Den potentiella nackdelen med att använda pärlor som kompensationskontroll är att emissionsspektrumet för den fluorescerande antikroppen som fångas på pärlor kan skilja sig från samma antikropp som används för att märka cellerna. Detta kan vara av särskild betydelse vid användning av en spektralflödescytometer20. Därför måste utvecklingen av pärlor som kompensationskontroll utföras på flödescytometern som kommer att användas för analysen för vilken pärlorna utvecklas. Dessutom måste utvecklingen av pärlorna inkludera en jämförelse med celler märkta med samma fluorescerande färgningsreagens.
Här beskriver vi beredningen av TCPP-aminfunktionaliserade polystyrenkompensationspärlor, vars medianfluorescensintensitet i detektionskanalen var jämförbar med den för TCPP-märkta celler i sputum, och deras användning som kompensationskontroller för flödescytometri. Autofluorescensen hos ekvivalenta, icke-funktionaliserade kulor var tillräckligt låg för att de skulle kunna användas som negativa fluorescenskompensationskontroller. Dessutom visade dessa pärlor stabilitet i lagring i nästan 1 år.
Trots de många tillämpningarna av porfyriner vid cancerdiagnostik och terapi2 finns det begränsad litteratur om deras potentiella användning som flödescytometriskt reagens för identifiering av cancerogena kontra icke-cancerösa cellpopulationer i primära mänskliga vävnader24,25,26. Vår forskning om flödescytometrisk analys av humant sputum24,27<sup class="xref…
The authors have nothing to disclose.
Vi vill tacka David Rodriguez för hjälp med figurberedning och Precision Pathology Services (San Antonio, TX) för användningen av dess Navios EX-flödescytometer.
Amber plastic vials, 2 mL, U- bottom, polypropylene | Research Products International | ZC1028-500 | |
Amine-funtionalized polystyrene divinylbenzene crosslinked (PS/DVB) beads, 10.6 μm diameter, 2.5% w/v aqueous suspension, 3.82 x 107 beads/mL, 7.11 x 1011 amine groups/ bead | Spherotech | APX-100-10 | Diameter spec. 8.0-12.9 um, suspension 2.5% w/v 3.82 x 107 beads/mL, 7.11 x 1011 amine groups/ bead |
Conical tubes, 50 mL, Falcon | Fisher Scientific | 14-432-22 | |
Centrifuge | with appropriate rotor | ||
Disposable polystyrene bottle with cap, 150 mL | Fisher Scientific | 09-761-140 | |
EDC (N- (3- dimethylaminopropyl)- N'- ethylcarbodiimide hydrochloride), ≥98% | Sigma | 03450-1G | CAS No: 25952-53-8 |
FlowJo Single Cell Analysis Software (v10.6.1) | BD | ||
Glass coverslips, 22 x 22 mm | Fisher Scientific | 12-540-BP | |
Glass fiber syringe filters (Finneran, 5 µm, 13 mm diameter) | Thomas Scientific | 1190M60 | |
Glass microscope slides, 275 x 75 x 1 mm | Fisher Scientific | 12-550-143 | |
Hanks Balanced Salt Solution (HBSS) | Fisher Scientific | 14-175-095 | |
Isopropanol, ACS grade | Fisher Scientific | AC423830010 | |
Mechanical pipette, 1 channel, 100-1000 uL with tips | Eppendorf | 3123000918 | |
MES (22- (N- mopholino)- N'- ethanesulfonic acid, hemisodium salt | Sigma | M0164 | CAS No: 117961-21-4 |
Navios EX flow cytometer | Beckman Coulter | ||
Olympus BX-40 microscope with DP73 camera and 40X objective with cellSens software | Olympus | or similar | |
Pasteur pipettes, glass, 5.75" | Fisher Scientific | 13-678-6B | |
pH meter (UB 10 Ultra Basic) | Denver Instruments | ||
Pipette controller (Drummond) | Pipete.com | DP101 | |
Plastic Syringe, 5 mL | Fisher Scientific | 14955452 | |
Polystyrene Particles (non-functionalized), SPHERO, 2.5% w/v, 8.0-12.9 µm | Spherotech | PP-100-10 | |
Polypropylene tubes, 15mL, conical | Fisher Scientific | 14-959-53A | |
Polystyrene tubes, round bottom | Fisher Scientific | 14-959-2A | |
Rainbow Beads (Spherotech URCP-50-2K) | Fisher Scientific | NC9207381 | |
Serological pipettes, disposable – 10 mL | Fisher Scientific | 07-200-574 | |
Serological pipettes, disposable – 25 mL | Fisher Scientific | 07-200-576 | |
Sodium bicarbonate (NaHCO3) | Sigma | S6014 | CAS No: 144-55-8 |
TCPP (meso-tetra(4-carboxyphenyl)porphine) Frontier Scientific | Fisher Scientific | 50-393-68 | CAS No: 14609-54-2 |
Tecan Spark Plate Reader (or similar) | Tecan Life Sciences | ||
Tube revolver/rotator | Thermo Fisher | 88881001 | |
Vortex mixer | Fisher Scientific | 2215365 |