Summary

Actina Co-sedimentación de ensayo, pues el análisis de proteína de unión a la F-actina

Published: March 28, 2008
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Summary

Proteínas se unen a la actina filamentosa (F-actina) a través de módulos de unión de actina distintas. En este video se demuestra el procedimiento de la actina co-sedimentación, que es un ensayo in vitro utilizan habitualmente para analizar las proteínas o dominios específicos que se unen a la F-actina.

Abstract

El citoesqueleto de actina en la célula es una red de filamentos de actina que permite el movimiento de las células y los procesos celulares, y que genera tensión y ayuda a mantener la forma celular. Aunque el citoesqueleto de actina es una estructura rígida, es una estructura dinámica que está en constante remodelación. Una serie de proteínas se puede unir al citoesqueleto de actina. La unión de una proteína en particular a la F-actina se desea a menudo para apoyar la célula observaciones biológicas o para comprender mejor los procesos dinámicos debido a la remodelación del citoesqueleto de actina. La actina co-sedimentación ensayo es un ensayo in vitro utilizan habitualmente para analizar la unión de proteínas específicas o dominios de la proteína con la F-actina. Los principios básicos de la prueba implica un período de incubación de la proteína de interés (de larga duración o el dominio de), con F-actina, paso ultracentrifugación para precipitar la F-actina y el análisis de la proteína co-sedimentación con F-actina. Actina sedimentación co-ensayos pueden ser diseñados para medir la afinidad de unión de actina y en los ensayos de la competencia.

Protocol

1. Preparación de la actina La fuente de la actina utilizada en este ensayo no era muscular plaquetas humanas (β-actina) obtenidos a partir del citoesqueleto Inc. alícuotas de archivo de 10 mg / ml se mantienen en el congelador -70 º C. Para el ensayo, la actina se diluye a 0,4 mg / ml en un tampón que contenía 5 mM Tris pH 8, 0,2 mM CaCl 2, 0,2 mM ATP y 0,5 mM de TDT, se centrifuga a 20.000 g durante 10 minutos a 4 º C. El sobrenadante, que es la actina monomérica está list…

Discussion

Actina co-sedimentación es un simple ensayo in vitro para analizar las proteínas de unión a specfic F-actina. En este vídeo, que muestran un ejemplo de cómo un sencillo actina co-sedimentación puede llevarse a cabo. Se muestra cómo preparar la F-actina, preparar la proteína a ser probado y el procedimiento de la actina co-sedimentación. Una serie de puntos deben ser considerados en el ejercicio de actina sedimentación co-ensayos. Por ejemplo, los componentes del tampón de incubación puede variar en función de la proteína a ser…

Acknowledgements

Gracias al Dr. Praveen Kumar en el laboratorio de Wittman en la UCSF para la película de la actina en células HaCaT.

Riferimenti

  1. Senetar, M. A., Foster, S. J., McCann, R. O. Intrasteric inhibition mediates the interaction of the I/LWEQ module proteins Talin1, Talin2, Hip1, and Hip12 with actin. Biochimica. 14, 15418-15428 (2004).
  2. Goldmann, W. H., Hess, D., Isenberg, G. The effect of intact talin and talin tail fragment on actin filament dynamics and structure depends on pH and ionic strength. Eur J Biochem. 260, 439-445 (1999).
  3. Lee, H., Bellin, R. M., Walker, D. L., Patel, B., Powers, P., Liu, H., Garcia-Alvarez, B., de Pereda, J., Liddington, R. C., Volkmann, N., Hanein, D., Critchley, D. R., Robson, R. M. Characterization of an Actin-binding Site within the Talin FERM Domain. J Mol Biol. 22, 771-784 (2004).
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Citazione di questo articolo
Srivastava, J., Barber, D. Actin Co-Sedimentation Assay; for the Analysis of Protein Binding to F-Actin. J. Vis. Exp. (13), e690, doi:10.3791/690 (2008).

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