Rivista
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여러 스케일에서 디지털의 연결 형태론의 자동 숄 분석
JoVE Journal
Neuroscienze
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JoVE Journal Neuroscienze
Automated Sholl Analysis of Digitized Neuronal Morphology at Multiple Scales
DOI:

11:41 min

November 14, 2010

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Capitoli

  • 00:00Titolo
  • 00:20Introduction
  • 01:20Preparations for Automated Sholl Analysis
  • 02:14Tracing Neurons in NeuronJ
  • 04:52Using Bonfire to Build Preliminary .swc Files from NeuronJ Data
  • 06:27Using NeuronStudio to Finalize .swc Files
  • 07:57Using ‘bonfire’ to Extract Morphological Data and ‘bonfire_results’ to View the Data
  • 09:06Using ‘bonfire_export’ to Export Data into Excel
  • 11:21Conclusion

Summary

Traduzione automatica

우리의 연결 형태를 분석하는 컴퓨터 프로그램을 개발했습니다. 두개의 기존 오픈 소스 분석 도구와 함께, 우리의 프로그램은 숄 분석을 수행하고 neurites, 지사 지점 및 neurite 팁의 수를 결정합니다. 분석은 neurite 형태의 지역 변화가 관찰 수 있도록 수행됩니다.

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