Rivista
/
Immunologia e infezioni
/
Genotypisk Inferens av HIV-1 Tropism Använda Befolkning-sekvensering av V3
JoVE Journal
Immunologia e infezioni
This content is Free Access.
JoVE Journal Immunologia e infezioni
Genotypic Inference of HIV-1 Tropism Using Population-based Sequencing of V3
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Genotypisk Inferens av HIV-1 Tropism Använda Befolkning-sekvensering av V3

DOI:
10.3791/2531-v

•

11:10 min

•

December 27, 2010

•

, ,
1Laboratory Program,BC Centre for Excellence in HIV/AIDS

Capitoli

  • 00:05Titolo
  • 01:25Amplification of HIV cDNA from Blood Plasma
  • 03:37Gel Electrophoresis
  • 04:29Sequencing
  • 07:18Data Analysis with Base Calling Software
  • 08:18The Geno2pheno Co-receptor Algorithm
  • 09:37Interpreting the Geno2pheno FPR
  • 10:37Conclusion

Summary

Traduzione automatica

Traduzione automatica

Hiv tropismen kan härledas från V3 regionen i virala kuvertet. V3 är PCR amplifieras i tre exemplar med kapslade RT-PCR, ordnat, och tolkas med hjälp av bioinformatiska mjukvara. Prover med med en eller flera sekvens (er) med låga G2P poäng klassificeras som icke-R5-virus.

Tags

HIV-1 TropismGenotypic InferencePopulation-based SequencingV3 RegionCCR5-antagonistViral PopulationCoreceptorTropism TestingViral RNAReverse Transcriptase-PCRSoftware AnalysisRE CallBioinformatic AlgorithmGeno2phenoFalse Positive Rate

Article

Embed

AGGIUNGI ALLA PLAYLIST

Usage Statistics

Video correlati

check_url/it/2531?article_type=v

Bedömning av immunologiskt Relevanta Dynamic tertiär strukturella drag av HIV-1 V3 Loop Crown R2 sekvens av Ab initio Folding
check_url/it/2531?article_type=v

Särskild märkning av HIV-1 positiva celler med hjälp av en Rev-beroende Lentiviral Vector uttrycka det grönt fluorescerande proteinet
check_url/it/2531?article_type=v

Prediktion av HIV-1 coreceptor användning (Tropism) genom sekvensanalys med en genotypisk strategi
check_url/it/2531?article_type=v

In vitro Uncoating av HIV-1 kärnor
check_url/it/2531?article_type=v

Nya verktyg för att expandera reglerande T-celler från HIV-1-infekterade individer
check_url/it/2531?article_type=v

Bedömning av Innate Sensing av HIV-1 infekterade CD4<sup> +</sup> T-celler från Plasmacytoid dendritiska celler med en<em> Ex vivo</em> Samodlingssystemet.
check_url/it/2531?article_type=v

Conformational Utvärdering av HIV-1 trimera Envelope Glycoproteins användning av en cellbaserad ELISA-analys
check_url/it/2531?article_type=v

Isolering av exosomes från plasma HIV-1 positiva individer
check_url/it/2531?article_type=v

Visualisering av HIV-1 Gag Bindning Giant enlamellvesikel (GUV) Membran
check_url/it/2531?article_type=v

mätning av<em> In Vitro</em> Integration Aktivitet av HIV-1 Preintegration Anläggningar

Read Article