Gennemsigtige zebrafisk embryoner har vist sig nyttig model værter til at visualisere og funktionelt studie samspil mellem medfødte immunceller og intracellulære bakterielle patogener, såsom<em> Salmonella typhimurium</em> Og<em> Mycobacterium marinum</em>. Micro-injektion af bakterier og multi-farve fluorescens billedbehandling er vigtige teknikker, der er involveret i anvendelsen af zebrafisk embryo infektion modeller.