/

/

ITS2序列数据库

JoVE Journal
Biologia
Author Produced

This content is Free Access.

JoVE Journal Biologia

The ITS2 Database

Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

ITS2序列数据库

DOI:

•

16:17 min

•

March 12, 2012

•

Benjamin Merget², Christian Koetschan, Thomas Hackl, Frank Förster, Thomas Dandekar, Tobias Müller, Jörg Schultz, Matthias Wolf

¹Department of Bioinformatics, Biocenter,University of Würzburg, ²Institute of Pharmacy and Food Chemistry,University of Würzburg

Capitoli

00:03Titolo
01:55Correct Annotation of ITS2 Sequence
03:30Secondary Structure Prediction
06:38Motif Search
08:07Search and Browse
10:21ITS2 BLAST
12:23Multiple Sequence-structure Alignment
13:46Phylogenetic Tree
14:47Additional Software
15:25Conclusion

Summary

Traduzione automatica

ITS2的数据库是一个进化的推论，同时考虑序列和二级结构的内部转录间隔2工作台。这包括数据收集，注释准确，结构预测，多序列结构的对齐和快速的计算。概括地说，这个工作台简化点几下首次系统发育分析。

Tags

ITS2 Database Internal Transcribed Spacer 2 Phylogenetic Marker ITS2 Sequence Secondary Structure Phylogenetic Resolution Species Delimitation NCBI GenBank Reannotated Sequences Hidden Markov Models Fold Prediction Homology Modeling Motif Detection BLAST Search Sequence-structure Information 4SALE ProfDistS

Article

Embed

AGGIUNGI ALLA PLAYLIST

Usage Statistics

Video correlati

漂白实验（FRAP和FLIP）来衡量生活胚胎干细胞的染色质的蛋白质动力学

从细胞中一氧化氮和超氧负离子自由基的电子顺磁共振光谱的检测，使用自旋陷阱

新生儿肝外胆管的隔离

鼠阀门内皮细胞的分离

使用MALDI-TOF质谱和自定义数据库的表征细菌土著一个独特的洞穴环境（卡切内岩洞，AZ，USA）

成像使用烟草瞬时表达系统MAPK信号通路的空间重组

带谱系特异标记的间充质细胞脂肪分化电位的可视化与量化

Adipo: 三维脂肪组织成像的组织清除方法

一种省力和可重复的触摸力信号突变屏幕协议,用于研究阿拉伯植物示范植物的三角性发生

纳索尼亚维特里彭尼斯的 Rnai 和克里斯普基因编辑的普帕尔和成人注射

Read Article