Rivista
/
Biologia
/
Den ITS2 Database
JoVE Journal
Biologia
Author Produced
This content is Free Access.
JoVE Journal Biologia
The ITS2 Database

Den ITS2 Database

DOI:
10.3791/3806-v

•

16:17 min

•

March 12, 2012

•

, , , , , , ,
1Department of Bioinformatics, Biocenter,University of Würzburg, 2Institute of Pharmacy and Food Chemistry,University of Würzburg

Capitoli

  • 00:03Titolo
  • 01:55Correct Annotation of ITS2 Sequence
  • 03:30Secondary Structure Prediction
  • 06:38Motif Search
  • 08:07Search and Browse
  • 10:21ITS2 BLAST
  • 12:23Multiple Sequence-structure Alignment
  • 13:46Phylogenetic Tree
  • 14:47Additional Software
  • 15:25Conclusion

Summary

Traduzione automatica

Traduzione automatica

Den ITS2 Database er et arbejdsbord for fylogenetisk følgeslutning samtidig betragtning sekvens og sekundære struktur af det indre transkriberede spacer 2. Dette omfatter indsamling af data med nøjagtig annotation, struktur forudsigelse, multipel sekvens-struktur tilpasning og hurtig træ beregning. I en nøddeskal, forenkler denne arbejdsbord første fylogenetiske analyser til nogle få klik.

Tags

ITS2 DatabaseInternal Transcribed Spacer 2Phylogenetic MarkerITS2 SequenceSecondary StructurePhylogenetic ResolutionSpecies DelimitationNCBI GenBankReannotated SequencesHidden Markov ModelsFold PredictionHomology ModelingMotif DetectionBLAST SearchSequence-structure Information4SALEProfDistS

Article

Embed

AGGIUNGI ALLA PLAYLIST

Usage Statistics

Video correlati

Photobleaching Assays (FRAP & FLIP) to Measure Chromatin Protein Dynamics in Living Embryonic Stem Cells

Påvisning af nitrogenoxid og superoxid Radical anion ved elektron paramagnetisk resonans-spektroskopi fra celler under anvendelse Spin Fælder

Isolering af Neonatal Ekstrahepatisk Cholangiocytes

Isolering af murint Ventil endotelceller

Anvendelse af MALDI-TOF-massespektrometri og en brugerdefineret database til Karakterisere Bakterier Indfødte til en unik Cave Miljø (Kartchner Caverns, AZ, USA)

Imaging Rumlig Reorganisering af et MAPK signalvej Brug af tobak Transient Expression System

Visualisering og kvantificering af mesenchymale celler Adipogenic differentiering potentiale med en afstamning specifikke markør

Adipo-klar: En væv Clearing metode til tredimensional billeddannelse af fedtvæv

En arbejdsbesparende og gentagelig touch-Force Signaling mutant Screen protokol til studiet af Thigmomorphogenesis af en model plante Arabidopsis thaliana

Pupal- og voksenindsprøjtninger til RNAi- og CRISPR-genredigering i Nasonia vitripennis

Read Article