Rivista
/
Biologia
/
Den ITS2 databas
JoVE Journal
Biologia
Author Produced
This content is Free Access.
JoVE Journal Biologia
The ITS2 Database
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Den ITS2 databas

DOI:
10.3791/3806-v

•

16:17 min

•

March 12, 2012

•

, , , , , , ,
1Department of Bioinformatics, Biocenter,University of Würzburg, 2Institute of Pharmacy and Food Chemistry,University of Würzburg

Capitoli

  • 00:03Titolo
  • 01:55Correct Annotation of ITS2 Sequence
  • 03:30Secondary Structure Prediction
  • 06:38Motif Search
  • 08:07Search and Browse
  • 10:21ITS2 BLAST
  • 12:23Multiple Sequence-structure Alignment
  • 13:46Phylogenetic Tree
  • 14:47Additional Software
  • 15:25Conclusion

Summary

Traduzione automatica

Traduzione automatica

Den ITS2 Database är en arbetsbänk för fylogenetisk inferens samtidig hänsyn sekvens och sekundär struktur av den interna transkriberade spacer 2. Detta inkluderar datainsamling med korrekt annotation, struktur prediktion, multipel sekvens-struktur inriktning och snabb träd beräkning. I ett nötskal, förenklas detta arbetsbänk första fylogenetiska analyser till några klick.

Tags

ITS2 DatabaseInternal Transcribed Spacer 2Phylogenetic MarkerITS2 SequenceSecondary StructurePhylogenetic ResolutionSpecies DelimitationNCBI GenBankReannotated SequencesHidden Markov ModelsFold PredictionHomology ModelingMotif DetectionBLAST SearchSequence-structure Information4SALEProfDistS

Article

Embed

AGGIUNGI ALLA PLAYLIST

Usage Statistics

Video correlati

Fotoblekning tester (FRAP & Flip) för att mäta Chromatin Protein Dynamics i Living embryonala stamceller

Detektering av kväveoxid och superoxidradikalanjonen genom elektronparamagnetisk resonans-spektroskopi från celler med användning av spin traps

Isolering av neonatal Extrahepatisk Cholangiocytes

Isolering av murint Ventil Endotelceller

Användning av MALDI-TOF-masspektometri och en anpassad Databas för att karaktärisera Bakterier ursprungsfolk till en unik grotta Miljö (Kartchner Caverns, AZ, USA)

Avbildning Rumslig Reorganisation av ett MAPK-signalvägen Använda Tobacco Transient Expression System

Visualisering och kvantifiering av mesenkymala Cell adipogena differentiering Potential med en härstamning specifik markör

Adipo-Clear: En vävnad Clearing metod för tredimensionell avbildning av fettvävnad

En arbetsbesparande och repeterbara touch-Force signalering Mutant skärm protokoll för studiet av Thigmomorphogenesis av en modell växt Arabidopsis thaliana

Pupal och vuxna injektioner för RNAi och CRISPR Genredigering i Nasonia vitripennis

Read Article