Rivista
/
/
Påvisning av sjeldne genomisk Varianter fra Pooled Sekvensering Bruke Splinter
JoVE Journal
Biologia
This content is Free Access.
JoVE Journal Biologia
Detection of Rare Genomic Variants from Pooled Sequencing Using SPLINTER
DOI:

14:06 min

June 23, 2012

, , , ,

Capitoli

  • 00:05Titolo
  • 01:28Pooled PCR Library Preparation and Sequencing
  • 04:46Sequencing Reads Alignment and Analysis
  • 07:35Rare Variant Detection using SPLINTER
  • 11:11SPLINTER Results: Detection of Rare Genomic Variants from Pooled Sequencing
  • 13:24Conclusion

Summary

Traduzione automatica

Pooled DNA sekvensering er en rask og kostnadseffektiv strategi for å oppdage sjeldne varianter assosiert med komplekse fenotyper i store kohorter. Her beskriver vi datamaskinell analyse av samlet, neste generasjons sekvensering av 32 kreft-relaterte gener ved hjelp av Splinter programvarepakken. Denne metoden er skalerbar, og gjelder for alle fenotype av interesse.

Video correlati

Read Article