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RNA Secondaria previsione della struttura utilizzando la forma di alta velocità
JoVE Journal
Biologia
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JoVE Journal Biologia
RNA Secondary Structure Prediction Using High-throughput SHAPE
DOI:

13:42 min

May 31, 2013

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Capitoli

  • 00:05Titolo
  • 01:40RNA Folding
  • 03:09Chemical Modification of the RNA
  • 04:33Reverse Transcription
  • 07:08Preparation of Sequencing Ladder and Capillary Electrophoresis
  • 09:55ShapeFinder Software
  • 11:15Data Normalization
  • 11:51Results: RNA Structure Determination using RNA Structure Software
  • 12:53Conclusion

Summary

Traduzione automatica

High-throughput selettivo 2 'acilazione idrossile analizzato da primer extension (SHAPE) utilizza un romanzo chemical probing tecnologia, la trascrizione inversa, elettroforesi capillare e software di predizione della struttura secondaria per determinare le strutture di RNA da diverse centinaia a diverse migliaia di nucleotidi a singolo nucleotide risoluzione.

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