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Un guide pratique pour Phylogenetics pour non-experts
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A Practical Guide to Phylogenetics for Nonexperts
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Un guide pratique pour Phylogenetics pour non-experts

DOI:
10.3791/50975-v

•

12:00 min

•

February 05, 2014

•

1Department of Biological Sciences and Institute for Neuroscience,The George Washington University

Capitoli

  • 00:05Titolo
  • 00:59Basic Local Alignment Search Tool (BLAST): Online Interface
  • 01:57BLAST: Local Executables for Windows
  • 03:52BLAST: Local Executables for Macs
  • 05:54Generating Multiple Sequence Alignments
  • 06:50Determining Best-fit Models of Evolution
  • 07:24Inferring Sequence Based Phylogenies by Maximum Likelihood or Bayesian Inference
  • 08:25Visualizing Phylogenies
  • 08:56Results: Similarity Searches, Alignments, Determining Best-fit Models, and Reconstructing Phylogenetic Trees
  • 11:29Conclusion

Summary

Traduzione automatica

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Nous décrivons ici un pipeline étape-par-étape pour générer phylogénies fiables de nucléotides ou d'acides aminés des ensembles de données de séquence. Ce guide vise à servir les chercheurs ou les étudiants nouveaux à l'analyse phylogénétique.

Tags

PhylogeneticsPhylogenetic AnalysisSequence AlignmentEvolutionary ModelsMaximum LikelihoodBayesian InferencePhylogenetic Tree VisualizationBioinformatics ToolsPractical GuideNonexpert Researchers

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