Här beskriver vi en fenotypisk analys som är tillämplig på höggenomströmning / höginnehållsskärmar av små-störande syntetiskt RNA (siRNA), kemisk förening och Mycobacterium tuberculosis mutant bibliotek. Denna metod förlitar sig på detektion av fluorescerande märkt Mycobacterium tuberkulos inom fluorescerande märkt värdcell med hjälp av automatiserad confocal mikroskopi.