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Bottom-up and Shotgun Proteomics to Identify a Comprehensive Cochlear Proteome
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Bottom-up e Shotgun Proteomica per identificare una completa Cochlear Proteome

DOI:
10.3791/51186-v

•

14:23 min

•

March 07, 2014

•

,
1Department of Otolaryngology, Morsani College of Medicine,University of South Florida

Capitoli

  • 00:05Titolo
  • 02:13Protein Extraction
  • 03:03Endoproteinase LysC and Tryptic Protein Digestion of Whole Lysate Using Filter Assisted Sample Preparation
  • 05:34Ion Exchange Chromatography
  • 06:20GELFREE Fractionation of Cochlear Sensory Epithelium
  • 07:54Protein Digestion of GELFREE Fractions Using Filter Assisted Sample Preparation
  • 10:07Results: Identification of membrane and Soluble Proteins by High-resolution Mass Spectrometry Analysis
  • 14:00Conclusion

Summary

Traduzione automatica

Traduzione automatica

Analisi del proteoma dell'epitelio sensoriale cocleare può essere difficile a causa della sua piccola dimensione e perché le proteine ​​di membrana sono difficili da isolare e identificare. Sia membrana e proteine ​​solubili possono essere identificati dalla combinazione di più metodi di preparazione e le tecniche di separazione con spettrometria di massa ad alta risoluzione.

Tags

Keywords: ProteomicsCochlear ProteomeMass SpectrometryProtein IdentificationSeparation TechniquesSample Fractionation2D-DIGEAntibody MicroarraySCXRPGELFrEE

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