Massespektrometrisk imaging (MSI) er et kraftig verktøy som kan brukes til å oppdage og identifisere ulike kjemiske stoffer i intakt vev, bevare forbindelsene i sine opprinnelige omgivelser, noe som kan gi ny innsikt i biologiske prosesser. Heri en MSI metode utviklet for analyse av små molekyler er beskrevet.