Rivista
/
Bioingegneria
/
Fra voxel til Kunnskap: En praktisk guide til Segmentering av Complex Elektronmikros 3D-Data
JoVE Journal
Bioingegneria
This content is Free Access.
JoVE Journal Bioingegneria
From Voxels to Knowledge: A Practical Guide to the Segmentation of Complex Electron Microscopy 3D-Data

Fra voxel til Kunnskap: En praktisk guide til Segmentering av Complex Elektronmikros 3D-Data

DOI:
10.3791/51673-v

•

12:08 min

•

August 13, 2014

•

, , , , , ,
1Life Sciences Division,Lawrence Berkeley National Laboratory, 2Joint Bioenergy Institute, Physical Biosciences Division,Lawrence Berkeley National Laboratory, 3National Energy Research Scientific Computing Center,Lawrence Berkeley National Laboratory

Capitoli

  • 00:05Titolo
  • 02:04Manual Abstracted Model Generation
  • 04:47Manual Tracing of Features of Interest
  • 08:10Automated Density-based Segmentation
  • 09:15Custom-tailored Automated Segmentation
  • 09:41Results: Application of Four Segmentation Approaches to Example Data Sets
  • 11:29Conclusion

Summary

Traduzione automatica

Traduzione automatica

Flaskehals for mobilnettet 3D elektronmikroskopi er funksjonen utvinning (segmentering) i svært komplekse 3D tetthetskart. Vi har utviklet et sett av kriterier, som gir veiledning om hvilke segmentering tilnærming (manuell, semi-automatisert, eller automatisert) er best egnet for ulike datatyper, og dermed gi et utgangspunkt for effektiv segmentering.

Tags

3D Electron MicroscopyUltrastructural OrganizationSegmentationVisualizationQuantificationResin Embedded Stained Electron TomographyFocused Ion Beam- And Serial Block Face- Scanning Electron MicroscopyManual Model BuildingManual TracingSemi-automated ApproachesAutomated Custom-designed Segmentation AlgorithmsSurface RenderingQuantitative AnalysisTriage Scheme

Article

Embed

AGGIUNGI ALLA PLAYLIST

Usage Statistics

Video correlati

Low-Cost Cryo-Light Microscopy Stage Fabrication for Correlated Light/Electron Microscopy

Design of a Cyclic Pressure Bioreactor for the Ex Vivo Study of Aortic Heart Valves

Fluorescens-slukking av en Liposomalinnkapslet Nær-infrarød fluoroforen som et verktøy for<em> I Vivo</em> Optisk Imaging

En guide til Strukturert Illumination TIRF Mikros i høy hastighet med flere farger

Samsvarende lys- og elektronmikroskopi Bruke Quantum Dot Nanopartikler

Correlative lys elektronmikroskop (CLEM) for sporing og Imaging Viral Protein forbundet strukturer i Cryo-immobilisert celler

Gene Expression analyse av endotelceller utsatt for skjæring Stress ved hjelp av flere parallelle-plate flyt Chambers

En Guide til å bygge et sterkt tilbøyelig feide flis mikroskop for utvidet felt-of-view Single-molekylet Imaging

Anvendelse av atomic force mikroskopi for å oppdage tidlig slitasjegikt

Enkeltcellet optisk virkningspotensial måling i humane induserte pluripotente stamcelleavledede kardiomyocytter

Read Article