Rivista
/
Biologia
/
Workflow til High-indhold, individuel celle Kvantificering af fluorescerende markører fra Universal Microscope data, støttet af Open Source Software
JoVE Journal
Biologia
This content is Free Access.
JoVE Journal Biologia
Workflow for High-content, Individual Cell Quantification of Fluorescent Markers from Universal Microscope Data, Supported by Open Source Software

Workflow til High-indhold, individuel celle Kvantificering af fluorescerende markører fra Universal Microscope data, støttet af Open Source Software

DOI:
10.3791/51882-v

•

09:57 min

•

December 16, 2014

•

,
1Cancer Biology,UCL Cancer Institute

Capitoli

  • 00:05Titolo
  • 01:17Reverse Transfection siRNA Screening
  • 03:20Imaging and Image Segmentation
  • 05:21Data Extraction
  • 07:39Results: Representative Raw Individual Cell Data Processing
  • 09:27Conclusion

Summary

Traduzione automatica

Traduzione automatica

Præsenteret er en fleksibel informatik workflow muliggør multiplex billede-analyse af fluorescens-mærkede celler. Arbejdsgangen kvantificerer nukleare og cytoplasmiske markører og beregner markør translokation mellem disse rum. Procedurer er tilvejebragt til forstyrrelse af celler under anvendelse af siRNA og pålidelig metode til markering detektion ved indirekte immunofluorescens i 96-brønds format.

Tags

Cell QuantificationFluorescent MarkersHigh-content MicroscopySingle-cell AnalysisCell HeterogeneityCell ProfilerOpen-source SoftwareSubcellular SegmentationSiRNA ScreenG1 Checkpoint RegulatorsCell PerturbationFluorescence-based Cellular Markers

Article

Embed

AGGIUNGI ALLA PLAYLIST

Usage Statistics

Video correlati

A Neuronal and Astrocyte Co-Culture Assay for High Content Analysis of Neurotoxicity

Imaging C. elegans Embryos using an Epifluorescent Microscope and Open Source Software

En kvantitativ Fitness Analyse Workflow

Et højt indhold Imaging Workflow til Uddannelse Grb2 signalering Komplekser ved ekspressionskloning

Profilering Individuelle humane embryonale stamceller ved kvantitativ RT-PCR

Sporing og kvantificere udviklingsprocesser i<em> C. elegans</em> Brug Open source Værktøj

Open Source High Content Analysis hjælp Automated Fluorescens Lifetime Imaging Microscopy

Cellular Redox Profiling ved hjælp af højindholdsmikroskopi

Open source Single-partikel Analyse for Super-resolution Microscopy med VirusMapper

IR-TEx: en open source data integration værktøj til Big data transkriptomics designet til malaria vektor Anopheles malariamyg

Read Article