Rivista
/
Biologia
/
Oprensning af Uren sekvensering Metagenomes og Metatranscriptomes fra komplekse Animal-associerede Prøver
JoVE Journal
Biologia
This content is Free Access.
JoVE Journal Biologia
Purifying the Impure: Sequencing Metagenomes and Metatranscriptomes from Complex Animal-associated Samples

Oprensning af Uren sekvensering Metagenomes og Metatranscriptomes fra komplekse Animal-associerede Prøver

DOI:
10.3791/52117-v

•

11:23 min

•

December 22, 2014

•

, , , , ,
1Department of Biology,San Diego State University, 2DOE Joint Genome Institute, 3Department of Molecular, Cellular and Developmental Biology,University of Colorado, 4Department of Pediatrics, School of Medicine,University of Colorado

Capitoli

  • 00:05Titolo
  • 02:01Sample Collection and Pre-treatment
  • 04:11Generating Viral Metagenome and Viral-like Particle Enrichment and Purification
  • 07:12Generating Microbial Metagenome
  • 08:57Results: Generation of Viral and Microbial Metagenomes
  • 10:44Conclusion

Summary

Traduzione automatica

Traduzione automatica

Brug af cystisk fibrose luftveje som et eksempel, manuskriptet præsenterer en omfattende workflow omfatter en kombination af metagenomisk og metatranscriptomic tilgange til at karakterisere mikrobielle og virale samfund i animalske-associerede prøver.

Tags

MetagenomicsMetatranscriptomicsHost-associated MicrobiomeCystic FibrosisSputumDNA ExtractionRNA ExtractionHigh-throughput SequencingMicrobial CommunityViral CommunityTaxonomyFunctional Analysis

Article

Embed

AGGIUNGI ALLA PLAYLIST

Usage Statistics

Video correlati

Purifying Plasmid DNA from Bacterial Colonies Using the Qiagen Miniprep Kit

Gross Dissection of the Stomach of the Lobster, Homarus Americanus

A Lectin HPLC Method to Enrich Selectively-glycosylated Peptides from Complex Biological Samples

Quantitation of γH2AX Foci in Tissue Samples

Kemisk blokeret antistof Microarray for Multiplexed Højkapacitetsforskning Profilering af specifikke protein Glycosylering i komplekse prøver

Detektion af sjældne genomiske varianter fra poolet sekventering under anvendelse Splinter

Den MultiBac Protein Complex Production Platform på EMBL

Målrettet RNA Sekventering Assay til karakterisere genekspression og Genomisk Alterations

Trække membran nanorør fra Giant Unilamellar blærer

Kvasi-metagenomic analyse af Salmonella fra mad og miljøprøver

Read Article