Rivista
/
Biologia
/
Zuiveren van de Onzuivere: Sequencing metagenomes en Metatranscriptomes van Complex-Animal geassocieerd Samples
JoVE Journal
Biologia
This content is Free Access.
JoVE Journal Biologia
Purifying the Impure: Sequencing Metagenomes and Metatranscriptomes from Complex Animal-associated Samples
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Zuiveren van de Onzuivere: Sequencing metagenomes en Metatranscriptomes van Complex-Animal geassocieerd Samples

DOI:
10.3791/52117-v

•

11:23 min

•

December 22, 2014

•

, , , , ,
1Department of Biology,San Diego State University, 2DOE Joint Genome Institute, 3Department of Molecular, Cellular and Developmental Biology,University of Colorado, 4Department of Pediatrics, School of Medicine,University of Colorado

Capitoli

  • 00:05Titolo
  • 02:01Sample Collection and Pre-treatment
  • 04:11Generating Viral Metagenome and Viral-like Particle Enrichment and Purification
  • 07:12Generating Microbial Metagenome
  • 08:57Results: Generation of Viral and Microbial Metagenomes
  • 10:44Conclusion

Summary

Traduzione automatica

Traduzione automatica

De cystic fibrosis luchtwegen als voorbeeld, het manuscript presenteert een uitgebreide workflow omvattende een combinatie van metagenomic en metatranscriptomic benaderingen van de microbiële en virale gemeenschappen in dieren door monsters te karakteriseren.

Tags

Keywords: MetagenomicsMetatranscriptomicsHost-associated MicrobiomeCystic FibrosisSputumDNA ExtractionRNA ExtractionHigh-throughput SequencingMicrobial CommunityViral CommunityTaxonomyFunctional Analysis

Article

Embed

AGGIUNGI ALLA PLAYLIST

Usage Statistics

Video correlati

check_url/it/52117?article_type=v

Zuiveren Plasmide DNA van bacteriële kolonies Met behulp van de Qiagen Miniprep Kit
check_url/it/52117?article_type=v

Bruto Dissectie van de maag van de Kreeft, Homarus Americanus</em
check_url/it/52117?article_type=v

Een Lectin HPLC-methode voor het selectief-geglycosyleerde Peptiden Enrich van complexe biologische monsters
check_url/it/52117?article_type=v

Kwantificatie van γH2AX Foci in weefselmonsters
check_url/it/52117?article_type=v

Chemisch-geblokkeerde Antilichaam Microarray voor multiplexverzending High-throughput Profilering van specifiek eiwit glycosylering in Complex Samples
check_url/it/52117?article_type=v

Detectie van zogenaamde Rare Genomic Varianten uit gepoold Sequencing gebruiken SPLINTER
check_url/it/52117?article_type=v

De MultiBac Protein Complex Production Platform in het EMBL
check_url/it/52117?article_type=v

Versterking, next-generation sequencing en Genomic DNA in kaart brengen van retrovirale integratie Sites
check_url/it/52117?article_type=v

Gerichte RNA Sequencing Assay Gene Expression en Genomic Wijzigingen karakteriseren
check_url/it/52117?article_type=v

Membraan Nanotubes trekken van Giant Unilamellar blaasjes

Read Article