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Aprimorada Redução Representação Bisulfite Sequencing para a Avaliação de metilação de DNA na resolução de pares de bases
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Enhanced Reduced Representation Bisulfite Sequencing for Assessment of DNA Methylation at Base Pair Resolution

Aprimorada Redução Representação Bisulfite Sequencing para a Avaliação de metilação de DNA na resolução de pares de bases

DOI:
10.3791/52246-v

•

13:47 min

•

February 24, 2015

•

, , , , , , , ,
1Department of Medicine,Weill Cornell Medical College, 2Institute for Computational Biomedicine,Weill Cornell Medical College, 3Department of Physiology and Biophysics,Weill Cornell Medical College, 4Department of Pathology,University of Michigan

Capitoli

  • 00:05Titolo
  • 02:22Adapter Ligation and DNA Size-selection via Gel Purification
  • 07:32Bisulfite Conversion, Enrichment PCR, and DNA Purification
  • 09:40Library Preparation for Sequencing
  • 10:42Results: ERRBS Yields Base Pair Resolution CpG Methylation Data
  • 12:15Conclusion

Summary

Traduzione automatica

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Enhanced Reduced Representation Bisulfite Sequencing is a method for the preparation of sequencing libraries for DNA methylation analysis based on restriction enzyme digestion combined with cytosine bisulfite conversion. This protocol requires 50 ng of starting material and yields base pair resolution data at GC-rich genomic regions.

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Keywords: DNA MethylationBisulfite SequencingReduced RepresentationERRBSBase Pair ResolutionQuantitative MethylationGenomic LociRestriction EnzymeNext-generation SequencingBioinformatics Analysis

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