Rivista
/
Medicina
/
Integratie van Nat en droog Bench Processen Optimaliseert Gerichte next-generation sequencing van lage kwaliteit en lage hoeveelheid tumorbiopten
JoVE Journal
Medicina
This content is Free Access.
JoVE Journal Medicina
Integration of Wet and Dry Bench Processes Optimizes Targeted Next-generation Sequencing of Low-quality and Low-quantity Tumor Biopsies
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Integratie van Nat en droog Bench Processen Optimaliseert Gerichte next-generation sequencing van lage kwaliteit en lage hoeveelheid tumorbiopten

DOI:
10.3791/53836-v

•

13:24 min

•

April 11, 2016

•

, , , ,
1Asuragen, Inc.

Capitoli

  • 00:05Titolo
  • 01:06DNA Functional Quantification and Quality Control
  • 02:55Library Preparation
  • 05:22Library Purification and Size Selection
  • 06:50Library Quantification
  • 08:21Library Normalization and Sample Pooling
  • 09:23Sequencing
  • 11:09Results: High-depth, Multiplexed Sequencing and Sensitive Analysis of Challenging Cancer Specimens by Targeted NGS
  • 13:01Conclusion

Summary

Traduzione automatica

Traduzione automatica

An integrated system for targeted next-generation sequencing of oncology specimens is described. This cross-platform system is optimized for low-quality and low-quantity tumor biopsies, accommodates low DNA inputs, includes well-characterized multi-variant controls, and features a novel variant caller that is informed by quantitative pre-analytical quality control measures.

Tags

Keywords: Targeted Next-generation SequencingLow-quality Tumor BiopsiesLow-quantity Tumor BiopsiesDNA Variant AnalysisQuantificationQualificationReal-time PCRDNA Template CopiesLibrary QuantificationSample PoolingWet And Dry Bench ProcessesBioinformatics

Article

Embed

AGGIUNGI ALLA PLAYLIST

Usage Statistics

Video correlati

check_url/it/53836?article_type=v

Patiënt Derived Cell Cultuur en isolatie van CD133<sup> +</sup> Vermeende Cancer Stem Cells van Melanoom
check_url/it/53836?article_type=v

Driedimensionale beeldvorming van Nociceptieve Intraepidermal zenuwvezels in Menselijke huid Biopsieën
check_url/it/53836?article_type=v

A Novel Hoge-resolutie<em> In vivo</em> Imaging techniek om de Dynamic Response van intracraniële structuren om tumorgroei en Therapeutics Studie
check_url/it/53836?article_type=v

En extractie van speeksel DNA voor Next Generation Sequencing
check_url/it/53836?article_type=v

Een volgende generatie Tissue microarray (ngTMA) Protocol voor Biomarker Studies
check_url/it/53836?article_type=v

Evaluatie van tumor-infiltrerende leukocyten subsets in een subcutane tumormodel
check_url/it/53836?article_type=v

Een hersentumor / organotypische Slice Co-cultuur voor het bestuderen tumor micro en Gerichte Drug therapieën
check_url/it/53836?article_type=v

Vervaardiging van een multifunctionele lage-kosten dierlijke Bench-model voor het onderwijs Tracheostomie
check_url/it/53836?article_type=v

Dubbele bioluminescentie beeldvorming van tumor progressie en angiogenese
check_url/it/53836?article_type=v

Intratracheale toediening van droge poederformulering bij muizen

Read Article