Rivista
/
Biologia
/
Komplet Workflow for Analyse af Histon post-translationelle modifikationer Brug Bottom-up-massespektrometri: Fra Histon Extraction til dataanalyse
JoVE Journal
Biologia
This content is Free Access.
JoVE Journal Biologia
Complete Workflow for Analysis of Histone Post-translational Modifications Using Bottom-up Mass Spectrometry: From Histone Extraction to Data Analysis

Komplet Workflow for Analyse af Histon post-translationelle modifikationer Brug Bottom-up-massespektrometri: Fra Histon Extraction til dataanalyse

DOI:
10.3791/54112-v

•

11:02 min

•

May 17, 2016

•

, , , ,
1Epigenetics Program, Department of Biochemistry and Biophysics, Perelman School of Medicine,University of Pennsylvania

Capitoli

  • 00:05Titolo
  • 01:07Isolation of Nuclei from Intact Cells
  • 03:18Extraction and Purification of Histones from Nuclei
  • 05:53Chemical Derivatization of Histones Using Propionic Anhydride for Bottom-up Analysis
  • 07:43Sample Desalting with Stage-tips
  • 08:59Results: Characterization of Histone Post-translational Modifications
  • 10:10Conclusion

Summary

Traduzione automatica

Traduzione automatica

Denne protokol beskriver en fuldt integreret arbejdsgang til karakterisering histon posttranslationelle modifikationer ved hjælp af massespektrometri (MS). Arbejdsgangen omfatter histon rensning fra cellekulturer eller væv, histon derivatisering og fordøjelse, MS analyse ved hjælp af nano-flow væskekromatografi og instruktioner til dataanalyse. Protokollen er designet til færdiggørelse i 2 - 3 dage.

Tags

Keywords: HistonePost-translational ModificationsMass SpectrometryBottom-up ProteomicsHistone ExtractionChromatin BiologyGene Expression RegulationChromosome CondensationEpigenetic ChangesChromatin OperationCell CultureHistone DerivatizationHistone DigestionNanoflow Liquid Chromatography

Article

Embed

AGGIUNGI ALLA PLAYLIST

Usage Statistics

Video correlati

check_url/it/54112?article_type=v

Detection of Post-translational Modifications on Native Intact Nucleosomes by ELISA
check_url/it/54112?article_type=v

Detection of Histone Modifications in Plant Leaves
check_url/it/54112?article_type=v

Ekspression Analyse af mammale Linker-histon Undertyper
check_url/it/54112?article_type=v

En kvantitativ Fitness Analyse Workflow
check_url/it/54112?article_type=v

Spirende Gær Protein ekstraktion og oprensning for Studiet af Function, Interactions og post-translationelle modifikationer
check_url/it/54112?article_type=v

Identifikation af post-translationelle modifikationer til planteprotein Complexes
check_url/it/54112?article_type=v

Bottom-up og Shotgun Proteomics at identificere en omfattende Cochlear Proteome
check_url/it/54112?article_type=v

Berigelse af ekstracellulære matrixproteiner fra væv og fordøjelse til peptider for massespektrometri Analyse
check_url/it/54112?article_type=v

Kvantificering af lokationsspecifikke Protein lysin Acetylation og Succinylation støkiometrisk ved hjælp af Data-uafhængig erhvervelse massespektrometri
check_url/it/54112?article_type=v

Prøveforberedelse til masse-massespektrometri-baseret Proteomics analyser af okulær Microvessels

Read Article