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Flux de travail complet pour l'analyse des histones modifications post-traductionnelles utilisant la spectrométrie de masse Bottom-up: De Histone Extraction à l'analyse des données
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Complete Workflow for Analysis of Histone Post-translational Modifications Using Bottom-up Mass Spectrometry: From Histone Extraction to Data Analysis
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Flux de travail complet pour l'analyse des histones modifications post-traductionnelles utilisant la spectrométrie de masse Bottom-up: De Histone Extraction à l'analyse des données

DOI:
10.3791/54112-v

•

11:02 min

•

May 17, 2016

•

, , , ,
1Epigenetics Program, Department of Biochemistry and Biophysics, Perelman School of Medicine,University of Pennsylvania

Capitoli

  • 00:05Titolo
  • 01:07Isolation of Nuclei from Intact Cells
  • 03:18Extraction and Purification of Histones from Nuclei
  • 05:53Chemical Derivatization of Histones Using Propionic Anhydride for Bottom-up Analysis
  • 07:43Sample Desalting with Stage-tips
  • 08:59Results: Characterization of Histone Post-translational Modifications
  • 10:10Conclusion

Summary

Traduzione automatica

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Ce protocole décrit un flux de travail entièrement intégrée pour caractériser histone modifications post-traductionnelles par spectrométrie de masse (MS). Le flux de travail comprend histone purification à partir de cultures de cellules ou de tissus, histone dérivatisation et la digestion, l'analyse de MS en utilisant la chromatographie et des instructions pour l'analyse des données de liquide nano-flux. Le protocole est conçu pour l'achèvement dans les 2 - 3 jours.

Tags

Keywords: HistonePost-translational ModificationsMass SpectrometryBottom-up ProteomicsHistone ExtractionChromatin BiologyGene Expression RegulationChromosome CondensationEpigenetic ChangesChromatin OperationCell CultureHistone DerivatizationHistone DigestionNanoflow Liquid Chromatography

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