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Flusso di lavoro completo per l'analisi dell'istone modificazioni post-traduzionali Utilizzando Bottom-up Spettrometria di Massa: Da istone estrazione all'analisi dei dati
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Complete Workflow for Analysis of Histone Post-translational Modifications Using Bottom-up Mass Spectrometry: From Histone Extraction to Data Analysis
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Flusso di lavoro completo per l'analisi dell'istone modificazioni post-traduzionali Utilizzando Bottom-up Spettrometria di Massa: Da istone estrazione all'analisi dei dati

DOI:
10.3791/54112-v

•

11:02 min

•

May 17, 2016

•

, , , ,
1Epigenetics Program, Department of Biochemistry and Biophysics, Perelman School of Medicine,University of Pennsylvania

Capitoli

  • 00:05Titolo
  • 01:07Isolation of Nuclei from Intact Cells
  • 03:18Extraction and Purification of Histones from Nuclei
  • 05:53Chemical Derivatization of Histones Using Propionic Anhydride for Bottom-up Analysis
  • 07:43Sample Desalting with Stage-tips
  • 08:59Results: Characterization of Histone Post-translational Modifications
  • 10:10Conclusion

Summary

Traduzione automatica

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Questo protocollo descrive un flusso di lavoro completamente integrato per la caratterizzazione di istone modificazioni post-traslazionali utilizzando la spettrometria di massa (MS). Il flusso di lavoro prevede la purificazione istone da colture di cellule o tessuti, istone derivatizzazione e la digestione, analisi MS utilizzando nano-flusso cromatografia liquida e le istruzioni per l'analisi dei dati. Il protocollo è stato progettato per il completamento entro 2 - 3 giorni.

Tags

Keywords: HistonePost-translational ModificationsMass SpectrometryBottom-up ProteomicsHistone ExtractionChromatin BiologyGene Expression RegulationChromosome CondensationEpigenetic ChangesChromatin OperationCell CultureHistone DerivatizationHistone DigestionNanoflow Liquid Chromatography

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