히스톤 추출에서 데이터 분석에 : 상향식 질량 분석 사용 히스톤 번역 후 변형 분석을위한 완벽한 워크 플로우

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Complete Workflow for Analysis of Histone Post-translational Modifications Using Bottom-up Mass Spectrometry: From Histone Extraction to Data Analysis

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히스톤 추출에서 데이터 분석에 : 상향식 질량 분석 사용 히스톤 번역 후 변형 분석을위한 완벽한 워크 플로우

DOI:

10.3791/54112-v

•

11:02 min

•

May 17, 2016

•

Simone Sidoli, Natarajan V. Bhanu, Kelly R. Karch, Xiaoshi Wang, Benjamin A. Garcia

¹Epigenetics Program, Department of Biochemistry and Biophysics, Perelman School of Medicine,University of Pennsylvania

Capitoli

00:05Titolo
01:07Isolation of Nuclei from Intact Cells
03:18Extraction and Purification of Histones from Nuclei
05:53Chemical Derivatization of Histones Using Propionic Anhydride for Bottom-up Analysis
07:43Sample Desalting with Stage-tips
08:59Results: Characterization of Histone Post-translational Modifications
10:10Conclusion

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이 프로토콜은 질량 분석기 (MS)를 사용하여 히스톤 번역 후 변형을 특성화하기위한 완벽하게 통합 된 워크 플로우를 설명합니다. 워크 플로는 나노 흐름 액체 크로마토 그래피 및 데이터 분석을위한 지침을 사용하여 세포 배양 또는 조직, 히스톤 유도체 및 소화, MS 분석에서 히스톤 정화를 포함한다. 삼일 -이 프로토콜은 2 내에 완성을 위해 설계되었습니다.

히스톤 추출에서 데이터 분석에 : 상향식 질량 분석 사용 히스톤 번역 후 변형 분석을위한 완벽한 워크 플로우

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