Rivista
/
Biologia
/
Komplett arbeidsflyt for analyse av Histone posttranslasjonelle modifikasjoner hjelp Bottom-up massespektrometri: Fra Histone Utvinning til dataanalyse
JoVE Journal
Biologia
This content is Free Access.
JoVE Journal Biologia
Complete Workflow for Analysis of Histone Post-translational Modifications Using Bottom-up Mass Spectrometry: From Histone Extraction to Data Analysis

Komplett arbeidsflyt for analyse av Histone posttranslasjonelle modifikasjoner hjelp Bottom-up massespektrometri: Fra Histone Utvinning til dataanalyse

DOI:
10.3791/54112-v

•

11:02 min

•

May 17, 2016

•

, , , ,
1Epigenetics Program, Department of Biochemistry and Biophysics, Perelman School of Medicine,University of Pennsylvania

Capitoli

  • 00:05Titolo
  • 01:07Isolation of Nuclei from Intact Cells
  • 03:18Extraction and Purification of Histones from Nuclei
  • 05:53Chemical Derivatization of Histones Using Propionic Anhydride for Bottom-up Analysis
  • 07:43Sample Desalting with Stage-tips
  • 08:59Results: Characterization of Histone Post-translational Modifications
  • 10:10Conclusion

Summary

Traduzione automatica

Traduzione automatica

Denne protokollen beskriver et fullstendig integrert arbeidsflyt for karakterisering av histon post-translasjonelle modifikasjoner ved bruk av massespektroskopi (MS). Arbeidsflyten inkluderer histone rensing fra cellekulturer eller vev, histon derivatisering og fordøyelse, MS analyse ved hjelp av nano-flow væskekromatografi og instruksjoner for dataanalyse. Protokollen er utformet for ferdigstillelse innen 2 - 3 dager.

Tags

Keywords: HistonePost-translational ModificationsMass SpectrometryBottom-up ProteomicsHistone ExtractionChromatin BiologyGene Expression RegulationChromosome CondensationEpigenetic ChangesChromatin OperationCell CultureHistone DerivatizationHistone DigestionNanoflow Liquid Chromatography

Article

Embed

AGGIUNGI ALLA PLAYLIST

Usage Statistics

Video correlati

check_url/it/54112?article_type=v

Detection of Post-translational Modifications on Native Intact Nucleosomes by ELISA
check_url/it/54112?article_type=v

Detection of Histone Modifications in Plant Leaves
check_url/it/54112?article_type=v

Expression Analyse av pattedyrs Linker-histone Subtyper
check_url/it/54112?article_type=v

En kvantitativ fitnessanalyse Workflow
check_url/it/54112?article_type=v

Spirende Gjær Protein Extraction og rensing for studier av funksjon, interaksjoner, og posttranslasjonelle modifikasjoner
check_url/it/54112?article_type=v

Identifisering av Post-translasjonell Modifikasjoner av Plant Protein komplekser
check_url/it/54112?article_type=v

Bottom-up og Shotgun Proteomikk å identifisere en omfattende Cochlea Proteome
check_url/it/54112?article_type=v

Anrikning av Ekstracellulære Matrix Proteiner fra Vev og Fordøyelse inn Peptider for massespektrometrianalyse
check_url/it/54112?article_type=v

Kvantifisering av områdespesifikke Protein lysin Acetylation og Succinylation støkiometri ved hjelp av Data-uavhengig oppkjøpet massespektrometri
check_url/it/54112?article_type=v

Eksempel forberedelse til masse-massespektrometri-baserte Proteomikk analyse av okulære Microvessels

Read Article