Transcriptomic Analysis of C. elegans RNA Sequencing Data Through the Tuxedo Suite on the Galaxy Project

Francis R. G. Amrit; Arjumand Ghazi

doi:10.3791/55473

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Análise transcriptomic de C. elegans RNA Sequenciação de dados através da Suíte Tuxedo no Projeto Galaxy

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Genetica

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Transcriptomic Analysis of C. elegans RNA Sequencing Data Through the Tuxedo Suite on the Galaxy Project

Análise transcriptomic de C. elegans RNA Sequenciação de dados através da Suíte Tuxedo no Projeto Galaxy

DOI:

10.3791/55473-v

•

10:19 min

•

April 08, 2017

•

Francis R. G. Amrit, Arjumand Ghazi

¹Department of Pediatrics,University of Pittsburgh School of Medicine, Children’s Hospital of Pittsburgh

Capitoli

00:05Titolo
00:56Getting Started with Galaxy
03:28Data Analysis with Tuxedo Suite
06:19Gene Ontology (GO) Term Analyses Using DAVID
07:56Results: Transcriptome Dictated by the Transcription Elongation Factor TCER-1, that Extends Lifespan of Germline-less C. elegans
09:39Conclusion

Summary

Traduzione automatica

Galaxy e David surgiram como ferramentas populares que permitem que os investigadores sem formação bioinformática para analisar e interpretar dados de RNA-Seq. Descreve-se um protocolo para C. elegans investigadores para executar ARN-Seq experiências, o acesso e processar o conjunto de dados usando Galaxy e obter informação biológica significativa a partir das listas de genes utilizando DAVID.

Análise transcriptomic de<em> C</em>.<em> elegans</em> RNA Sequenciação de dados através da Suíte Tuxedo no Projeto Galaxy

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