Rivista
/
Genetica
/
Optimalisering og sammenligningsanalyse av organellar DNA-berigelsesmetoder som er egnet for neste generasjons sekvensering
JoVE Journal
Genetica
È necessario avere un abbonamento a JoVE per visualizzare questo.  Accedi o inizia la tua prova gratuita.
JoVE Journal Genetica
Optimization and Comparative Analysis of Plant Organellar DNA Enrichment Methods Suitable for Next-generation Sequencing

Optimalisering og sammenligningsanalyse av organellar DNA-berigelsesmetoder som er egnet for neste generasjons sekvensering

DOI:
10.3791/55528-v

•

12:33 min

•

July 28, 2017

•

, ,
1Cereal Disease Laboratory,United States Department of Agriculture-Agricultural Research Service, 2Department of Horticultural Science,University of Minnesota, 3Department of Plant Pathology,University of Minnesota

Capitoli

  • 00:05Titolo
  • 00:49Growing Wheat Plants
  • 01:51Organellar DNA Enrichment by Differential Centrifugation (DC)
  • 07:31Organellar DNA Enrichment by Methyl-fractionation (MF)
  • 09:44Results: Both Enrichment Methods Yield Sufficient DNA Highly Enriched for Organellar Sequences and Suitable for NGS
  • 11:33Conclusion

Summary

Traduzione automatica

Traduzione automatica

Sammenligningen og optimaliseringen av to organellar DNA-anrikningsmetoder presenteres: Tradisjonell differensial sentrifugering og fraksjonering av totalt gDNA basert på metyleringsstatus. Vi vurderer den resulterende DNA-kvantiteten og kvaliteten, demonstrerer ytelse i kortlestende neste generasjons sekvensering, og drøfter potensialet for bruk i langlestende enkeltmolekylesekvensering.

Tags

Plant OrganelleDNA EnrichmentNext-generation SequencingDifferential CentrifugationMeta FractionationWheat SeedlingOrganelle IsolationSTE BufferFiltration

Article

Embed

AGGIUNGI ALLA PLAYLIST

Usage Statistics

Video correlati

Metyl-binding DNA-fangst Sekvense for Pasientservietter

Vurdering av DNA forurensning i RNA eksempler basert på Ribosomal DNA

Rensing av High Molecular Weight Genomisk DNA fra meldugg for Long-Les Sekvense

Robust DNA isolasjon og høy gjennomstrømming sekvensering biblioteket konstruksjon for Herbarium prøver

Neste generasjons sekvensering og bioinformatikk rørledning for å evaluere genetisk determinanter av konstitusjonelle sykdom

Sjelden hendelse gjenkjenning feil-korrigert DNA og RNA sekvensering

Forsterkning av nær full lengde HIV-1-Proviruses for neste generasjons sekvensering

Høy gjennomstrømming identifikasjon av regulatoriske gensekvenser med neste generasjons sekvensering av runde kromosom konformasjon fange (4C-seq)

RNA neste generasjons sekvensering og en bioinformatikk rørledning for å identifisere uttrykt linje-1s på det geometriske-spesifikke nivået

Single-molekylet Förster resonans energi overføring metoder for Real-Time gransking av Holliday Junction oppløsning av GEN1

Read Article