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जीन सेट संवर्धन विश्लेषण का उपयोग करने के लिए अनुवाद अनुसंधान के लिए उपयुक्त पशु मॉडल की पहचान के लिए एक प्रोटोकॉल
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A Protocol for Using Gene Set Enrichment Analysis to Identify the Appropriate Animal Model for Translational Research
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जीन सेट संवर्धन विश्लेषण का उपयोग करने के लिए अनुवाद अनुसंधान के लिए उपयुक्त पशु मॉडल की पहचान के लिए एक प्रोटोकॉल

DOI:
10.3791/55768-v

•

09:35 min

•

August 16, 2017

•

, , , , ,
1Department of Experimental Toxicology and ZEBET,German Federal Institute for Risk Assessment (BfR), 2Department of Clinical Pharmacology and Toxicology,Charité-Universitätsmedizin Berlin

Capitoli

  • 00:05Titolo
  • 00:54Performing the Game Set Enrichment Analysis (GSEA)
  • 05:46Comparing the GSEA Results and Identifying the Optimal Animal Model
  • 07:55Results: Overlap of Pathway Regulation Identifies Suitable and Unsuitable Animal Models
  • 08:49Conclusion

Summary

Traduzione automatica

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हम transcriptomic डेटा के जीन सेट संवर्धन विश्लेषण के उपयोग के लिए एक मानकीकृत प्रोटोकॉल प्रदान करने के लिए अनुवाद अनुसंधान के लिए एक आदर्श माउस मॉडल की पहचान ।
इस प्रोटोकॉल डीएनए microarray और आरएनए अनुक्रमण डेटा के साथ इस्तेमाल किया जा सकता है और डेटा उपलब्ध हैं, तो आगे अन्य ओमिक्स डेटा के लिए बढ़ाया जा सकता है.

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Keywords: Gene Set Enrichment AnalysisAnimal ModelTranslational ResearchGenome DataMouse ModelsInflammatory DiseasesGene Expression StudiesGene Expression DataPhenotype FileMolecular Signature DatabaseDNA Chip AnnotationsGSEA SoftwareGene SymbolsPermutations

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