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RNA 结合区质量谱鉴定的样品制备
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Biochimica
Sample Preparation for Mass Spectrometry-based Identification of RNA-binding Regions
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RNA 结合区质量谱鉴定的样品制备
DOI:
10.3791/56004-v
•
10:52 min
•
September 28, 2017
•
Robert Warneford-Thomson
4
,
Chongsheng He
2
,
Simone Sidoli
3
,
Benjamin A. Garcia
3
,
Roberto Bonasio
2
1
Epigenetics Institute
,
University of Pennsylvania Perelman School of Medicine
,
2
Department of Cell and Developmental Biology
,
University of Pennsylvania Perelman School of Medicine
,
3
Department of Biochemistry and Biophysics
,
University of Pennsylvania Perelman School of Medicine
,
4
Graduate Group in Biochemistry and Biophysics
,
University of Pennsylvania Perelman School of Medicine
Capitoli
00:05
Titolo
01:04
Crosslink of Protein-RNA Interactions in Live Cells
03:26
Isolation of Nuclei
04:27
Lysis of Nuclei and Trypsin Digestion
05:51
Desalting of Peptides
07:39
Removal of Crosslinked RNA
08:44
Results: RNA-binding Protein and RNA-binding Region Identification
10:04
Conclusion
Summary
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Traduzione automatica
我们描述了一个协议, 以确定 rna 结合蛋白和地图他们的 rna 结合区域的活细胞使用紫外介导的光和质谱。
Tags
Sample Preparation
Mass Spectrometry
RNA-binding Proteins
UV Cross-linking
4sU Labeling
Cell Fractionation
Immunoprecipitation
Protein-RNA Interactions
Epigenetics
Cell Culture
Mouse Embryonic Stem Cells
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