Rivista
/
Biologia
/
Volumen segmentering og analyse af biologiske materialer ved hjælp af SuRVoS (Super-regionen volumen segmentering) Workbench
JoVE Journal
Biologia
This content is Free Access.
JoVE Journal Biologia
Volume Segmentation and Analysis of Biological Materials Using SuRVoS (Super-region Volume Segmentation) Workbench

Volumen segmentering og analyse af biologiske materialer ved hjælp af SuRVoS (Super-regionen volumen segmentering) Workbench

DOI:
10.3791/56162-v

•

11:38 min

•

August 23, 2017

•

, , , , , , ,
1Science Division, Harwell Science and Innovation Campus,Diamond Light Source, 2School of Computer Science,University of Nottingham

Capitoli

  • 00:05Titolo
  • 00:53Preparing the Workplace, Data Representation, and Generating Appropriate Super-regions
  • 03:19Introduction to Annotation
  • 04:12Segmentation Using Model Training
  • 05:41Segmentation Using Super-regions
  • 06:42Classifiction and Analysis of Data Objects Based on Inherent Characteristics
  • 09:00Results: Model Training, Super-region Segmentation, and Label Splitting Using the SuRVoS Workbench
  • 10:55Conclusion

Summary

Traduzione automatica

Traduzione automatica

Segmentering af tre-dimensionelle data fra mange Billeddannende teknikker er en stor flaskehals i analyse af komplekse biologiske systemer. Her, vi beskriver brugen af SuRVoS Workbench til semi-automatisk segment volumetriske data på forskellige længdeskalaer ved hjælp af eksempel datasæt fra cryo-elektron tomografi, cryo bløde X-ray computertomografi og fase kontrast X-ray computertomografi teknikker.

Tags

Volume SegmentationBiological MaterialsSuRVoSSuper-region Volume SegmentationWorkbenchStructural BiologyPhase Contrast X-ray TomographyFeature ChannelsSuper VoxelsAnnotationImage SegmentationData AnalysisMaterial Science

Article

Embed

AGGIUNGI ALLA PLAYLIST

Usage Statistics

Video correlati

Large Volume (20L+) Filtration of Coastal Seawater Samples

Small Volume (1-3L) Filtration of Coastal Seawater Samples

Concentration Determination of Nucleic Acids and Proteins Using the Micro-volume Bio-spec Nano Spectrophotometer

Aseptiske Laboratorieteknikker: Volume overførsler med Serologiske pipetter og Micropipettors

Genopbygning af 3-dimensionel Histologi Volumen og dens anvendelse til at studere mus mælkekirtler

Cardiac Pressure-Volume Loop Analyse Brug Ledningsevne Katetre i mus

Måling af tryk Volume Loops i Mus

ACT-PRESTO: Biologisk Tissue Clearing og immunolabeling Metoder til Volume Imaging

Biologiske prøveforberedelse højtryks frysebehandling, mikrobølgeovn-assisteret kontrastforbedring og Minimal harpiks indlejring for volumen Imaging

Arraytomografiarbejdsgang for målrettet anskaffelse af volumenoplysninger ved hjælp af scanningselektronmikroskopi

Read Article