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Volume de segmentação e análise de materiais biológicos, usando a bancada de trabalho de SuRVoS (região super Volume segmentação)
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JoVE Journal Biologia
Volume Segmentation and Analysis of Biological Materials Using SuRVoS (Super-region Volume Segmentation) Workbench

Volume de segmentação e análise de materiais biológicos, usando a bancada de trabalho de SuRVoS (região super Volume segmentação)

DOI:
10.3791/56162-v

•

11:38 min

•

August 23, 2017

•

, , , , , , ,
1Science Division, Harwell Science and Innovation Campus,Diamond Light Source, 2School of Computer Science,University of Nottingham

Capitoli

  • 00:05Titolo
  • 00:53Preparing the Workplace, Data Representation, and Generating Appropriate Super-regions
  • 03:19Introduction to Annotation
  • 04:12Segmentation Using Model Training
  • 05:41Segmentation Using Super-regions
  • 06:42Classifiction and Analysis of Data Objects Based on Inherent Characteristics
  • 09:00Results: Model Training, Super-region Segmentation, and Label Splitting Using the SuRVoS Workbench
  • 10:55Conclusion

Summary

Traduzione automatica

Traduzione automatica

Segmentação de dados tridimensionais de muitas técnicas de imagem é um grande gargalo em análise de sistemas biológicos complexos. Aqui, descrevemos o uso de SuRVoS Workbench para semi automaticamente dados de volumétrica do segmento em diversas escalas de comprimento usando conjuntos de dados de exemplo de técnicas de tomografia computadorizada de raios-x de contraste fase, cryo macio tomography do raio x e tomografia computadorizada do cryo-elétron.

Tags

Volume SegmentationBiological MaterialsSuRVoSSuper-region Volume SegmentationWorkbenchStructural BiologyPhase Contrast X-ray TomographyFeature ChannelsSuper VoxelsAnnotationImage SegmentationData AnalysisMaterial Science

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