Rivista
/
Genetica
/
Eksempel forberedelse og analyse av RNASeq-baserte genuttrykk Data fra sebrafisk
JoVE Journal
Genetica
È necessario avere un abbonamento a JoVE per visualizzare questo.  Accedi o inizia la tua prova gratuita.
JoVE Journal Genetica
Sample Preparation and Analysis of RNASeq-based Gene Expression Data from Zebrafish

Eksempel forberedelse og analyse av RNASeq-baserte genuttrykk Data fra sebrafisk

DOI:
10.3791/56187-v

•

11:42 min

•

October 27, 2017

•

, ,
1Division of Endocrinology, Diabetes and Nutrition, Department of Medicine,University of Maryland School of Medicine

Capitoli

  • 00:05Titolo
  • 01:04Generating Embryos Through Natural Mating and Staging Embryos
  • 02:22Whole Embryo Dissociation, RNA Extraction and Purify High-quality RNA
  • 04:55Sorting Differentially Expressed Genes
  • 07:00Determine Enriched Pathways
  • 07:57Generation of Pathway Networks and Determination of Enriched GO Terms
  • 09:12Results: RNAseq-based Zebrafish Genome Expression Data for Alstrom and Bardet Biedl Syndromes
  • 10:47Conclusion

Summary

Traduzione automatica

Traduzione automatica

Denne protokollen gir en tilnærming for hele transcriptome analyse fra sebrafisk embryo, larvene, eller sortert celler. Vi inkluderer isolering av RNA, sti analyse av RNASeq data, og qRT-PCR-baserte valideringen av genet uttrykk endringer.

Tags

RNASeqGene ExpressionZebrafishEmbryoLarvaTranscriptomeSample PreparationRNA ExtractionRNA SequencingBiologia dello sviluppoComparative Analysis

Article

Embed

AGGIUNGI ALLA PLAYLIST

Usage Statistics

Video correlati

check_url/it/56187?article_type=v

Parallell Måling av biologiske klokke genekspresjon og hormon i Human primære cellekulturer
check_url/it/56187?article_type=v

Encellede Gene Expression Profilering hjelp FACS og qPCR med interne standarder
check_url/it/56187?article_type=v

Studier av celle-regulert genuttrykk av to komplementære cellesynkroniseringsprotokoller
check_url/it/56187?article_type=v

Toveis retroviral integrasjonssted PCR-metodikk og kvantitativ dataanalyse arbeidsflyt
check_url/it/56187?article_type=v

Måle genuttrykk i bombet Bygg Aleurone lag med økt gjennomstrømming
check_url/it/56187?article_type=v

En Optogenetic metode for å styre og analysere Gene Expression mønstre i celle til celle interaksjoner
check_url/it/56187?article_type=v

En isoinokosterone reseptor-baserte entall Gene bryter for bevisst uttrykk for Transgene robusthet, Reversibilitet og ubetydelig Leakiness
check_url/it/56187?article_type=v

Utforske rot Microbiome: utpakking bakterielle samfunnet Data fra jord, Rhizosphere og rot Endosphere
check_url/it/56187?article_type=v

Informatic analyse av sekvens Data fra satsvis gjær 2-Hybrid-skjermer
check_url/it/56187?article_type=v

Opprettholde biologisk kulturer og måle byggkorn under Aphis nerii: en ikke-modellsystem for plante-insekt interaksjoner

Read Article