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ゲノムワイドな探索とグレープバインで ATL E3 ユビキチンリガーゼ遺伝子家族の表現メタ分析のための包括的なワークフロー

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Comprehensive Workflow for the Genome-wide Identification and Expression Meta-analysis of the ATL E3 Ubiquitin Ligase Gene Family in Grapevine

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ゲノムワイドな探索とグレープバインで ATL E3 ユビキチンリガーゼ遺伝子家族の表現メタ分析のための包括的なワークフロー

DOI:

10.3791/56626-v

•

10:40 min

•

December 22, 2017

•

Pietro Ariani*¹, Elodie Vandelle*¹, Darren Wong, Alejandro Giorgetti, Andrea Porceddu, Salvatore Camiolo, Annalisa Polverari

¹Dipartimento di Biotecnologie,Università degli Studi di Verona, ²Ecology and Evolution, Research School of Biology,The Australian National University, ³Dipartimento di Agraria, SACEG,Università degli Studi di Sassari

Capitoli

00:05Titolo
01:04Identifying Putative Gene Family Members, Making Alignments, and Sequence Logos
03:33Phylogenetic Analysis and Nomenclature
06:51Tissue Expression Meta-analysis
08:27Results: Identified ATL Gene Family Members in the Grapevine Genome
09:52Conclusion

Summary

Traduzione automatica

この記事は、同定とLevadura でシロイヌナズナ Tóxicos (ATL) E3 ユビキチンリガーゼの家族に適用されるグレイプバインの遺伝子ファミリーの解析手順を説明します。

Tags

Keywords: Genome-wide Identification Expression Meta-analysis ATL E3 Ubiquitin Ligase Gene Family Grapevine Gene Structure Protein Motifs Chromosomal Location Gene Duplications Expression Patterns Gene Family Characterization Protein BLAST PSI-BLAST FASTA Bioinformatics Software

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