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Quantificação de Estoicometria de Acetilação e Succinilação de Lisinas Proteicas em Sítios Específicos Usando Espectrometria de Massa de Aquisição de Dados Independente
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Quantification of Site-specific Protein Lysine Acetylation and Succinylation Stoichiometry Using Data-independent Acquisition Mass Spectrometry

Quantificação de Estoicometria de Acetilação e Succinilação de Lisinas Proteicas em Sítios Específicos Usando Espectrometria de Massa de Aquisição de Dados Independente

DOI:
10.3791/57209-v

•

12:49 min

•

April 04, 2018

•

, ,
1Buck Institute for Research on Aging

Capitoli

  • 00:04Titolo
  • 01:18Quantitatively Acetylate and/or Succinylate Proteins Using Isotope-labeled Acetic or Succinic Anhydride
  • 03:48Digest Reacted Protein Samples Using Glu-C Endoproteinase
  • 06:27Fractionate Peptides Using Offline Basic-pH Reversed Phase HPLC
  • 08:15Example Data Analysis Tutorial
  • 10:28Results: Succinylation Stoichiometry Ratio Calculation of Pre-succinylated BSA
  • 11:13Conclusion

Summary

Traduzione automatica

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Aqui, apresentamos a quantificação imparcial de ocupação acetilação e/ou succinylation proteína site-specific (estequiometria) de um proteome inteira através de uma análise ratiometric de modificações endógenas às modificações introduzidas após quantitativa química acilação usando anidridos rotulado de isótopo estáveis. Em combinação com a espectrometria de massa sensível aquisição de dados independente, obtêm-se medições de ocupação do local exato.

Tags

Keywords: Site-specific Protein Lysine AcetylationSite-specific Protein Lysine SuccinylationStoichiometryData-independent Acquisition Mass SpectrometryPost-translational ModificationProtein RegulationLysine AcylationChemical AcetylationChemical SuccinylationFragment Ion Quantification

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