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Promotor Capture Hallo-c: Hochauflösende, genomweite Profilierung der Promoter Interaktionen
JoVE Journal
Genetica
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JoVE Journal Genetica
Promoter Capture Hi-C: High-resolution, Genome-wide Profiling of Promoter Interactions
DOI:

10:16 min

June 28, 2018

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Capitoli

  • 00:04Titolo
  • 00:52Formaldehyde Fixation
  • 02:14HindIII Digestion and Biotinylation of Restriction Fragment Overhangs
  • 04:09Hybrid In-solution Capture
  • 06:53Isolation of Promoter Fragment-containing Ligation Products
  • 08:55Results: IL8 PCHi-C Profile in Human Hematopoietic Cells
  • 09:34Conclusion

Summary

Traduzione automatica

DNA-regulatorische Elementen, wie z. B. Enhancer, Steuern Genexpression durch Kontaktaufnahme mit körperlich Ziel Gen Promotoren, oft durch weiträumige chromosomalen Interaktionen über genomische Entfernungen. Promotor erfassen Hi-C (PCHi-C) identifiziert signifikante Wechselwirkungen zwischen Promotoren und distalen Regionen ermöglicht die Zuordnung von möglichen regulatorischen Sequenzen, deren Zielgene.

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