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Retrospective MicroRNA Sequencing: Complementary DNA Library Preparation Protocol Using Formalin-fixed Paraffin-embedded RNA Specimens

Sequenciação de MicroRNA retrospectiva: Biblioteca de DNA complementar preparação protocolo usando amostras de RNA de parafina fixada em formol

DOI:
10.3791/57471-v

•

12:24 min

•

May 05, 2018

•

, , ,
1Department of Research,Hackensack University Medical Center, 2Department of Medical Sciences,Seton Hall University, 3Department of Epidemiology and Population Health,Albert Einstein College of Medicine, 4Department of Nephrology and Hypertension,Hadassah – Hebrew University Medical Center

Capitoli

  • 00:04Titolo
  • 00:393′ Barcoded Adapter Ligations with 18 Individual RNA Samples
  • 02:00Ligated Small RNA Purification
  • 05:265′ Ligated and 3′ Barcoded Purified Small RNAs Reverse Transcription
  • 08:12Pilot PCR and Large-scale PCR Amplification
  • 10:46Results: Protocol Robust Whether Fresh, Frozen, or Aged
  • 12:01Conclusion

Summary

Traduzione automatica

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Fixada em formol parafina espécimes representam uma fonte valiosa de biomarcadores moleculares de doenças humanas. Aqui nós apresentamos um protocolo de preparação de biblioteca de base laboratorial do cDNA, inicialmente projetado com RNA congelado fresco e otimizado para a análise de microRNAs arquivados de tecidos armazenados até 35 anos.

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Keywords: MicroRNASequencingCDNA LibraryFormalin-fixed Paraffin-embeddedRNAProtocolLigationAdapterPrecipitationCentrifugation

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