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ExCYT : Une Interface graphique pour simplifier Analysis of High-Dimensional Data de cytométrie en flux
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Immunologia e infezioni
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JoVE Journal Immunologia e infezioni
ExCYT: A Graphical User Interface for Streamlining Analysis of High-Dimensional Cytometry Data
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ExCYT : Une Interface graphique pour simplifier Analysis of High-Dimensional Data de cytométrie en flux

DOI:
10.3791/57473-v

•

05:12 min

•

January 16, 2019

•

, , , , , ,
1The Bloomberg~Kimmel Institute for Cancer Immunotherapy,Johns Hopkins University School of Medicine, 2The Sidney Kimmel Comprehensive Cancer Center,Johns Hopkins University School of Medicine, 3Department of Biomedical Engineering,Johns Hopkins University School of Medicine, 4Department of Immunology,Johns Hopkins University School of Medicine, 5Department of Pathology,Johns Hopkins University School of Medicine

Capitoli

  • 00:04Titolo
  • 00:24t-SNE Distributed Stochastic Neighbor Embedding (SNE)
  • 01:30Cluster Analysis, Filtration, and Visualization
  • 03:22Results: Representative Recapitulation of Myeloid and Lymphoid Sub-Population Data
  • 04:53Conclusion

Summary

Traduzione automatica

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ExCYT est une base MATLAB utilisateur Interface graphique (GUI) qui permet aux utilisateurs d’analyser leurs données de cytométrie de flux via couramment employé des techniques d’analyse de données grande dimension, y compris la réduction de dimensionnalité via t-SNE, une variété d’automatisés et manuels parcelles de nouveaux flux de grande dimension, heatmaps et méthodes de clustering.

Tags

CytometryHigh-dimensional AnalysisT-SNEClusteringCell PopulationsMarker-specific AnalysisThresholdHeat MapBox PlotFlow Plot

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