Rivista
/
Genetica
/
En roman mætning mutagenese tilgang: Trinvist karakterisering af regulerende Protein bindende websteder i RNA ved hjælp af Phosphorothioates
JoVE Journal
Genetica
È necessario avere un abbonamento a JoVE per visualizzare questo.  Accedi o inizia la tua prova gratuita.
JoVE Journal Genetica
A Novel Saturation Mutagenesis Approach: Single Step Characterization of Regulatory Protein Binding Sites in RNA Using Phosphorothioates

En roman mætning mutagenese tilgang: Trinvist karakterisering af regulerende Protein bindende websteder i RNA ved hjælp af Phosphorothioates

DOI:
10.3791/57816-v

•

11:49 min

•

August 21, 2018

•

1Department of Molecular, Cellular and Developmental Biology,University of Colorado at Boulder

Capitoli

  • 00:04Titolo
  • 00:30Generation of a Library of Mutants – Doping DNA Template with Non-wild Type Nucleotides
  • 01:20Synthesis of RNA
  • 05:24Protein Binding Reaction and Separation of Bound RNA
  • 08:05Analysis of Iodine-cleaved Phosphorothioate Products for Detection of Mutant Nucleotide Positions
  • 09:07Results: Characterization of Protein Binding Site in RNA
  • 10:22Conclusion

Summary

Traduzione automatica

Traduzione automatica

Proteiner der binder specifik RNA sekvenser spiller vigtige roller i genekspression. Detaljeret beskrivelse af disse bindingssteder er afgørende for vores forståelse af genet. Her, er en trinvis fremgangsmåde for mætning mutagenese af protein bindingssteder i RNA beskrevet. Denne tilgang er relevant for alle protein bindingssteder i RNA.

Tags

Keywords: Saturation MutagenesisPhosphorothioatesRNAProtein Binding SiteIn Vitro TranscriptionT7 RNA Polymerase5′ End LabelingAlpha-thio NTPAlkaline PhosphataseT4 Polynucleotide KinaseGene Regulation

Article

Embed

AGGIUNGI ALLA PLAYLIST

Usage Statistics

Video correlati

check_url/it/57816?article_type=v

Novel RNA-bindende proteiner Isolering af den hurtige metode
check_url/it/57816?article_type=v

Optogenetic Tilfældig mutagenese ved anvendelse histon-miniSOG i<em> C. elegans</em
check_url/it/57816?article_type=v

Påvisning af Copy Number Ændringer Brug Single Cell Sequencing
check_url/it/57816?article_type=v

Kortlægning af RNA-RNA-interaktioner globalt ved anvendelse af biotinyleret psoralen
check_url/it/57816?article_type=v

Målrettet<em> I Situ</em> Mutagenese af histon-gener i knopskydende gær
check_url/it/57816?article_type=v

Retroviral Scanning: Kortlægning af MLV Integration Sites til at definere Cell-specifikke Regulatory Regions
check_url/it/57816?article_type=v

Bestemmelse af Optimal kromosomale placering for en DNA Element i Escherichia coli ved hjælp af en roman Transposon-medieret tilgang
check_url/it/57816?article_type=v

Høj overførselshastighed identifikation af regulerende gensekvenser ved hjælp af næste generations sekventering af cirkulære kromosom kropsbygning Capture (4C-seq)
check_url/it/57816?article_type=v

Sekvensering af mRNA fra fuldblod ved hjælp af Nanopmalm sekvensering
check_url/it/57816?article_type=v

Massespektrometri-baseret Proteomics analyser ved hjælp af OpenProt Database til at afsløre nye proteiner oversat fra ikke-kanoniske åbne læserammer

Read Article