Rivista
/
Genetica
/
Dissektion af Enhancer funktion ved hjælp af Multiplex CRISPR-baserede forstærker interferens i cellelinjer
JoVE Journal
Genetica
This content is Free Access.
JoVE Journal Genetica
Dissection of Enhancer Function Using Multiplex CRISPR-based Enhancer Interference in Cell Lines

Dissektion af Enhancer funktion ved hjælp af Multiplex CRISPR-baserede forstærker interferens i cellelinjer

DOI:
10.3791/57883-v

•

10:46 min

•

June 02, 2018

•

, ,
1Department of Oncological Sciences, Huntsman Cancer Institute,University of Utah

Capitoli

  • 00:05Titolo
  • 00:37Guide RNA Design
  • 03:37Guide RNA Cloning
  • 06:27Transfection of Enhancer-I, Cell Harvest, and RNA Extraction
  • 08:21Results: Guide RNA Design/Cloning and Evaluation of Gene Expression in Response to Enhancer-i
  • 09:23Conclusion

Summary

Traduzione automatica

Traduzione automatica

Denne protokol beskriver de nødvendige skridt for at designe og udføre multipleksede målretning af smagsforstærkere med deaktiverende fusion protein SID4X-dCas9-KRAB, også kendt som forstærker interferens (forstærker-i). Denne protokol giver mulighed for identifikation af smagsforstærkere, der regulerer genekspression og letter dissektion af relationer mellem smagsforstærkere regulerer en fælles mål-genet.

Tags

Keywords: CRISPREnhancer InterferenceGene RegulationTranscriptionGuide RNA DesignE-CRISPUCSC Genome BrowserBLATGenome AssemblyOff-targetProtospacer-adjacent MotifGenomics

Article

Embed

AGGIUNGI ALLA PLAYLIST

Usage Statistics

Video correlati

check_url/it/57883?article_type=v

RNA-interferens-baserede Undersøgelse af funktion Heat Shock Protein 27 under hornhindeepitelkulturer Sårheling
check_url/it/57883?article_type=v

Single-celle genekspression Brug Multiplex RT-qPCR at Karakterisere Meget forskellige sjældne Lymfoide populationer
check_url/it/57883?article_type=v

Påvisning af Copy Number Ændringer Brug Single Cell Sequencing
check_url/it/57883?article_type=v

Chromatin-immunpræcipitation (ChIP) i mus-T-cellelinier
check_url/it/57883?article_type=v

Ved hjælp af musen oocyter at vurdere menneskelige genfunktion under meiose jeg
check_url/it/57883?article_type=v

Genom-redigering i pattedyr cellelinjer ved hjælp af CRISPR-Cas
check_url/it/57883?article_type=v

Manipulation af genfunktioner i mexicansk Cavefish
check_url/it/57883?article_type=v

Massespektrometri-baseret Proteomics analyser ved hjælp af OpenProt Database til at afsløre nye proteiner oversat fra ikke-kanoniske åbne læserammer
check_url/it/57883?article_type=v

Design automatiseret, høj gennemløb, kontinuerlig cellevækst eksperimenter ved hjælp af eVOLVER
check_url/it/57883?article_type=v

Samlede CRISPR-baserede genetiske skærme i pattedyrsceller

Read Article