Rivista
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Caracterização de Microbiome carrapato de próxima geração 16S rRNA Amplicon sequenciação
JoVE Journal
Biologia
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JoVE Journal Biologia
Tick Microbiome Characterization by Next-Generation 16S rRNA Amplicon Sequencing
DOI:

07:21 min

August 25, 2018

,

Capitoli

  • 00:04Titolo
  • 00:44Tick Surface Sterilization, DNA Purification, and 16S rRNA Gene Amplification
  • 02:3016S Amplicon Purification
  • 03:59Sample Barcoding and Purification
  • 04:58Library Quantification and Normalization
  • 06:01Results: Community Ecology of the Ixodes Microbiome
  • 06:43Conclusion

Summary

Traduzione automatica

Aqui nós apresentamos um protocolo de sequenciamento de próxima geração para sequenciação de rRNA 16S, que permite a identificação e caracterização das comunidades microbianas na vetores. Este método envolve a extração de DNA, amplificação e código de barras das amostras através de PCR, sequenciamento em uma pilha de fluxo e bioinformática para combinar dados de sequência de informação filogenética.

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