Rivista
/
Genetica
/
Nieuwe reeks ontdekking door subtractieve Genomics
JoVE Journal
Genetica
È necessario avere un abbonamento a JoVE per visualizzare questo.  Accedi o inizia la tua prova gratuita.
JoVE Journal Genetica
Novel Sequence Discovery by Subtractive Genomics
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Nieuwe reeks ontdekking door subtractieve Genomics

DOI:
10.3791/58877-v

•

09:40 min

•

January 25, 2019

•

, ,
1Biology Department,American University

Capitoli

  • 00:04Titolo
  • 01:08De novo Assemble Starting Sequence
  • 02:03BLAST the Assembly Against the Reference Sequence
  • 04:44Design Primers for the Sequence that Remains
  • 06:25qPCR Validation of the Remaining Sequence
  • 07:51Results: Example Data of qPCR Results Including Negative and Positive Outcomes
  • 08:53Conclusion

Summary

Traduzione automatica

Traduzione automatica

Het doel van dit protocol is met een combinatie van rekenkundige en onderzoek van de Bank te vinden van nieuwe sequenties die niet gemakkelijk kunnen worden gescheiden van een mede zuiverende sequentie, die slechts gedeeltelijk bekend kan zijn.

Tags

Keywords: Novel Sequence DiscoverySubtractive GenomicsGenomic SequencesInexpensiveFlexibleBacterial Vaccine TargetsVirus IdentificationUnknown SeparationReference SequenceTrimmomaticPearReptileTrinityBlastTransdeckorTblastn

Article

Embed

AGGIUNGI ALLA PLAYLIST

Usage Statistics

Video correlati

check_url/it/58877?article_type=v

In vitro transcriptie Testen en hun toepassing in Drug Discovery
check_url/it/58877?article_type=v

Novel-RNA-bindende eiwitten Isolatie door de snelle Methodologie
check_url/it/58877?article_type=v

Conjugative Mating Testen voor sequentie-specifieke analyse van Transfer eiwitten die betrokken zijn in bacterieconjugatie
check_url/it/58877?article_type=v

Bepaling van de optimale chromosomale locatie (s) voor een DNA Element in Escherichia coli met behulp van een nieuwe benadering van Transposon-gemedieerde
check_url/it/58877?article_type=v

Hoog vet dieet voeding en High Throughput triglyceride test bij Drosophila Melanogaster
check_url/it/58877?article_type=v

Volgorde-specifieke en selectieve erkenning van Double-stranded RNAs over Single-stranded RNAs van chemisch gewijzigd Peptide nucleïnezuren
check_url/it/58877?article_type=v

Informatic analyse van sequencedata van Batch gist 2-Hybrid schermen
check_url/it/58877?article_type=v

Het rangschikken van mRNA van geheel bloed gebruikend Nanogaatje het rangschikken
check_url/it/58877?article_type=v

Navigeren MARRVEL, een web-based tool die Human Genomics en model organisme genetica informatie integreert
check_url/it/58877?article_type=v

Sequentie ruimte verkennen om bindende sites te identificeren voor regulatoire RNA-bindende eiwitten

Read Article